More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3505 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  100 
 
 		 281 aa  557  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  75.63 
 
 		 299 aa  421  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  75.18 
 
 		 280 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  78.87 
 
 		 273 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  77.24 
 
 		 279 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  75.47 
 
 		 272 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  77.86 
 
 		 279 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  73.67 
 
 		 279 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  76.12 
 
 		 279 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  75.67 
 
 		 272 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  74.26 
 
 		 273 aa  408  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  75.65 
 
 		 278 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.43 
 
 		 260 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  73.43 
 
 		 279 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  61.31 
 
 		 277 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  60.59 
 
 		 274 aa  341  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  61.65 
 
 		 276 aa  337  9e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  60.45 
 
 		 276 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.53 
 
 		 276 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  59.77 
 
 		 278 aa  330  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  60.53 
 
 		 276 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  59.62 
 
 		 274 aa  328  9e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  61.28 
 
 		 266 aa  326  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  61.22 
 
 		 263 aa  325  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  60.45 
 
 		 270 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  62.17 
 
 		 263 aa  323  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  61.28 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  61.19 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  60.46 
 
 		 269 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  60.89 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  60.84 
 
 		 269 aa  318  6e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  59.7 
 
 		 269 aa  318  6e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  61.36 
 
 		 265 aa  318  7e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  59.7 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  56.74 
 
 		 281 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  58.56 
 
 		 271 aa  316  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  58.21 
 
 		 270 aa  312  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  57.25 
 
 		 291 aa  311  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  58.58 
 
 		 271 aa  310  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  58.56 
 
 		 269 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  57.84 
 
 		 271 aa  308  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  58.02 
 
 		 267 aa  308  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  59.47 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  57.52 
 
 		 272 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.95 
 
 		 263 aa  302  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  57.14 
 
 		 276 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  62.78 
 
 		 272 aa  302  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  57.14 
 
 		 272 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  57.95 
 
 		 263 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  57.2 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  57.52 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  56.3 
 
 		 283 aa  299  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  60.9 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  55.92 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  53.6 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  53.31 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.81 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 		 234 aa  249  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  55.79 
 
 		 235 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  52.96 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  55.37 
 
 		 235 aa  242  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  52.28 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  50.83 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.07 
 
 		 239 aa  235  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  50.76 
 
 		 258 aa  235  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  51.65 
 
 		 234 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  51.45 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.23 
 
 		 239 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  49.81 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  48.85 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 236 aa  233  3e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  51 
 
 		 242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  50.62 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  46.79 
 
 		 286 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  52.48 
 
 		 233 aa  232  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  51.65 
 
 		 234 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  53.31 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  46.67 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  52.07 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  49.59 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  53.28 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  53.28 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  50.2 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  50.41 
 
 		 253 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.53 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  54.13 
 
 		 236 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  52.07 
 
 		 241 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  51.24 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  51.04 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  51.24 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  50 
 
 		 238 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  51.17 
 
 		 254 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.37 
 
 		 254 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  52.7 
 
 		 236 aa  224  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  50.82 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  49.39 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>