More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000399 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 
273 aa  547  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  83.64 
 
 
272 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  83.27 
 
 
272 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  79.85 
 
 
273 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  83.46 
 
 
260 aa  448  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  79.92 
 
 
280 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  80.77 
 
 
279 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  79.85 
 
 
279 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  78.31 
 
 
279 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  75.9 
 
 
299 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  79.85 
 
 
279 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  78.87 
 
 
281 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  74.62 
 
 
278 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  69.89 
 
 
279 aa  387  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  66.03 
 
 
263 aa  350  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  64.5 
 
 
266 aa  345  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  62.26 
 
 
274 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  62.03 
 
 
276 aa  340  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  60.29 
 
 
278 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  64.12 
 
 
266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  61.65 
 
 
281 aa  337  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  61.65 
 
 
276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  61.19 
 
 
269 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  60.45 
 
 
269 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  61.71 
 
 
270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  62.74 
 
 
269 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  61.19 
 
 
269 aa  335  7e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.53 
 
 
276 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  60.53 
 
 
276 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  60.75 
 
 
274 aa  332  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  60.82 
 
 
269 aa  332  5e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  57.61 
 
 
277 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  59.18 
 
 
271 aa  329  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  61.57 
 
 
270 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  61.51 
 
 
274 aa  329  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  61.83 
 
 
263 aa  328  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  60.98 
 
 
270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  61.6 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  60.31 
 
 
291 aa  326  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  61.22 
 
 
276 aa  325  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  59.54 
 
 
267 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  58.96 
 
 
271 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  58.58 
 
 
272 aa  322  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  61.07 
 
 
265 aa  322  5e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  58.58 
 
 
271 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  59.85 
 
 
269 aa  316  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 
263 aa  311  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  58.56 
 
 
263 aa  310  2e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  59.7 
 
 
263 aa  310  2e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  62.88 
 
 
272 aa  309  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  61.89 
 
 
276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  54.68 
 
 
283 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  53.66 
 
 
253 aa  279  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  53.25 
 
 
258 aa  266  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.81 
 
 
257 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  51.81 
 
 
258 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  57.68 
 
 
235 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 
234 aa  255  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  55.56 
 
 
239 aa  255  6e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  57.44 
 
 
235 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  55.14 
 
 
239 aa  253  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  51.04 
 
 
264 aa  251  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  52.24 
 
 
249 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  52.92 
 
 
236 aa  251  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  57.26 
 
 
234 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  53.72 
 
 
237 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  49.62 
 
 
257 aa  248  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  55.6 
 
 
234 aa  248  8e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  52.49 
 
 
258 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  54.17 
 
 
233 aa  247  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  51.04 
 
 
237 aa  247  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  54.17 
 
 
237 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.24 
 
 
258 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  56.02 
 
 
239 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  48.28 
 
 
286 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  50.4 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  55.19 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  50.62 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  53.94 
 
 
237 aa  242  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  53.11 
 
 
235 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  53.94 
 
 
234 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  54.17 
 
 
236 aa  241  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  54.96 
 
 
237 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  48.56 
 
 
238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  54.55 
 
 
241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  48.28 
 
 
265 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  53.94 
 
 
241 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  53.94 
 
 
241 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  54.69 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  52.72 
 
 
233 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 
238 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 
238 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 
238 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 
238 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 
238 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 
238 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  48.77 
 
 
253 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  48.36 
 
 
253 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  48.15 
 
 
238 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>