More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0381 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  100 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  89.85 
 
 		 276 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  85.4 
 
 		 274 aa  494  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  87.97 
 
 		 276 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  84.89 
 
 		 278 aa  483  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  86.47 
 
 		 276 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  86.47 
 
 		 276 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  76.32 
 
 		 291 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  76.3 
 
 		 271 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  74.62 
 
 		 270 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  75.93 
 
 		 271 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  72.76 
 
 		 270 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  72.83 
 
 		 271 aa  411  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  71.64 
 
 		 269 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  71.64 
 
 		 269 aa  407  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  72.73 
 
 		 269 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  73.58 
 
 		 267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  72.93 
 
 		 274 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  71.97 
 
 		 269 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  70.04 
 
 		 269 aa  401  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  72.18 
 
 		 267 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  70.3 
 
 		 281 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  68.27 
 
 		 277 aa  394  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  60.61 
 
 		 263 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  60.75 
 
 		 273 aa  332  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  60.38 
 
 		 263 aa  328  8e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  59.62 
 
 		 281 aa  328  8e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  61.51 
 
 		 264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  60.3 
 
 		 266 aa  326  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  58.43 
 
 		 266 aa  325  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  59.7 
 
 		 279 aa  324  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  58.71 
 
 		 263 aa  322  3e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  59.7 
 
 		 279 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  59.09 
 
 		 263 aa  322  5e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  58.43 
 
 		 272 aa  322  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  59.32 
 
 		 279 aa  321  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  57.84 
 
 		 272 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.71 
 
 		 263 aa  319  3e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  58.3 
 
 		 299 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  58.74 
 
 		 269 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 		 260 aa  318  5e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  58.94 
 
 		 279 aa  318  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  58.56 
 
 		 279 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  58.94 
 
 		 280 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  58.33 
 
 		 273 aa  316  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  56.25 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  61.41 
 
 		 253 aa  316  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  57.41 
 
 		 272 aa  315  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  58.56 
 
 		 278 aa  315  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  59.18 
 
 		 270 aa  314  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  56.39 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  60.98 
 
 		 272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  55.68 
 
 		 283 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  60.38 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  60.61 
 
 		 276 aa  305  6e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  59.75 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  58.92 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.09 
 
 		 257 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  57.66 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  56.63 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  57.26 
 
 		 254 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  54.51 
 
 		 257 aa  281  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.52 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.91 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  52.24 
 
 		 266 aa  255  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  49.05 
 
 		 258 aa  244  9e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  47.73 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  53.72 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  46.99 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  50.59 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  53.28 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  51.45 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.53 
 
 		 234 aa  238  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  53.94 
 
 		 235 aa  238  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 259 aa  238  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  46.1 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  52.07 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  52.07 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  52.7 
 
 		 235 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  51.64 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  52.46 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  51.04 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  49.17 
 
 		 236 aa  231  8.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  51.65 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  51.04 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  51.24 
 
 		 237 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  53.09 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.78 
 
 		 239 aa  228  7e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.38 
 
 		 234 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 247 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  50.83 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49.79 
 
 		 236 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  50 
 
 		 245 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  49.59 
 
 		 247 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  50.62 
 
 		 233 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  48.39 
 
 		 239 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  51.23 
 
 		 247 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>