More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43710 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  100 
 
 		 258 aa  512  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  87.16 
 
 		 258 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  86.33 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  61.81 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  65.15 
 
 		 271 aa  322  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  65.15 
 
 		 271 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  64.92 
 
 		 264 aa  321  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  67.21 
 
 		 266 aa  321  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  65.02 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  60.73 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  63.37 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  59.84 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.23 
 
 		 276 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  59.34 
 
 		 278 aa  301  6.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  59.34 
 
 		 269 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  58.23 
 
 		 276 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  58.54 
 
 		 270 aa  300  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  59.34 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  62.04 
 
 		 267 aa  300  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  59.75 
 
 		 274 aa  298  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  57.31 
 
 		 281 aa  297  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  63.11 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  58.92 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  59.34 
 
 		 269 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  62.6 
 
 		 254 aa  295  7e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  59.34 
 
 		 269 aa  294  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  62.7 
 
 		 253 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  58.51 
 
 		 274 aa  291  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  58.4 
 
 		 274 aa  291  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  56.91 
 
 		 270 aa  289  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 258 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  58.09 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  54.26 
 
 		 283 aa  281  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  56 
 
 		 277 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  56.43 
 
 		 263 aa  281  9e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  56.38 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  52.96 
 
 		 299 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  53.25 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  52.55 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  54.76 
 
 		 280 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  54.29 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  53.6 
 
 		 281 aa  262  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  53.53 
 
 		 266 aa  261  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  261  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  54.37 
 
 		 279 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  53.97 
 
 		 278 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  52.16 
 
 		 279 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  53.53 
 
 		 276 aa  258  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  53.94 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  52.42 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  53.11 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  54.55 
 
 		 269 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  46.83 
 
 		 272 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  51.87 
 
 		 263 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  52.67 
 
 		 272 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 		 260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  52.89 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  51.39 
 
 		 272 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  51.87 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  51.04 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  46.67 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  48.76 
 
 		 272 aa  241  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 		 263 aa  241  6e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  54.84 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  52.07 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  53.01 
 
 		 272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 234 aa  232  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  52.07 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  47.01 
 
 		 286 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  49.18 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 276 aa  224  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  47.33 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  48.77 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50.41 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  44.88 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  45.68 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  50.83 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  46.31 
 
 		 247 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  47.72 
 
 		 234 aa  218  8.999999999999998e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  47.52 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  49.17 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  47.11 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  49.57 
 
 		 239 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  48.05 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  49.38 
 
 		 246 aa  215  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 		 233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  49.79 
 
 		 235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  47.13 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  44.86 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  48.55 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  46.69 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.59 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  46.22 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  48.13 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 		 238 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 238 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>