More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2986 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  70.97 
 
 		 253 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  59.51 
 
 		 267 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  59.44 
 
 		 276 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  59.44 
 
 		 276 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  58.13 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  60.42 
 
 		 291 aa  299  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  60.48 
 
 		 264 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  60.91 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.87 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  57.72 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  58.27 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  58.92 
 
 		 269 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  58.09 
 
 		 269 aa  293  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  57.32 
 
 		 278 aa  292  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  58.94 
 
 		 276 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  57.68 
 
 		 269 aa  292  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 		 267 aa  291  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  57.26 
 
 		 269 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  56.18 
 
 		 274 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  57.09 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  56.85 
 
 		 269 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  57.32 
 
 		 276 aa  289  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  56.25 
 
 		 277 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  56.38 
 
 		 271 aa  288  9e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  58.2 
 
 		 257 aa  288  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  54.05 
 
 		 281 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  56.52 
 
 		 274 aa  285  7e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 		 270 aa  284  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  58.3 
 
 		 253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  56.02 
 
 		 270 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  58.13 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  57.89 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  54.77 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  53.69 
 
 		 266 aa  262  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  58.2 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.02 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  51.45 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  51.87 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  52.21 
 
 		 279 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  49.02 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  50.2 
 
 		 299 aa  254  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  51.98 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  51.45 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  51.45 
 
 		 263 aa  252  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  52.46 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  51.55 
 
 		 281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  51.6 
 
 		 272 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  52.46 
 
 		 270 aa  251  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  52.61 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  54.22 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  49.02 
 
 		 273 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  52.26 
 
 		 279 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  51.81 
 
 		 279 aa  248  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  54.13 
 
 		 265 aa  248  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  47.27 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  51.45 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  52.28 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 272 aa  244  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  51.85 
 
 		 283 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 260 aa  241  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  52.03 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 276 aa  238  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  51.22 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  51.04 
 
 		 269 aa  234  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  47.35 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  50.83 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  46.67 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  222  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 235 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  46.18 
 
 		 265 aa  218  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  46.28 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  49.38 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  47.3 
 
 		 234 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  49.38 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.96 
 
 		 235 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.13 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  47.52 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  49.39 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  49.39 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  46.15 
 
 		 239 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  46.15 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4420  ABC transporter related  46.37 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  46.69 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  47.11 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  47.93 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  46.06 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.89 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  47.72 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 234 aa  205  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  47.93 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  47.11 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  46.94 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>