More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1547 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  100 
 
 
276 aa  553  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  89.67 
 
 
272 aa  467  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  62.98 
 
 
263 aa  338  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  62.12 
 
 
299 aa  332  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  61.74 
 
 
278 aa  328  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  61.89 
 
 
273 aa  328  8e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  61.6 
 
 
263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  61.36 
 
 
276 aa  326  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  60.98 
 
 
274 aa  325  5e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.7 
 
 
263 aa  325  7e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  58.94 
 
 
263 aa  325  7e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  61.83 
 
 
266 aa  324  8.000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  59.93 
 
 
273 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  59.32 
 
 
263 aa  323  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  59.56 
 
 
276 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  59.56 
 
 
276 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  60.61 
 
 
274 aa  322  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  60.61 
 
 
272 aa  321  7e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  58.78 
 
 
279 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  60.98 
 
 
279 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  59.09 
 
 
272 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  60.69 
 
 
265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  59.54 
 
 
266 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  58.18 
 
 
276 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.55 
 
 
260 aa  318  5e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  60.53 
 
 
271 aa  318  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  60.61 
 
 
279 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  60.98 
 
 
280 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  60.61 
 
 
279 aa  316  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  59.7 
 
 
272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  57.45 
 
 
272 aa  311  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  60.9 
 
 
281 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  57.41 
 
 
276 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  59.85 
 
 
278 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  57.84 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  55.07 
 
 
291 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  57.84 
 
 
271 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  57.09 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  57.58 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  56.88 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  56.27 
 
 
267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  57.09 
 
 
269 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  56.98 
 
 
269 aa  301  6.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  56.98 
 
 
270 aa  301  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  57.2 
 
 
269 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  58.33 
 
 
270 aa  300  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  59.25 
 
 
279 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  57.36 
 
 
270 aa  299  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  57.03 
 
 
281 aa  298  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  55.68 
 
 
269 aa  295  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  54.71 
 
 
274 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  54.68 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  51.25 
 
 
283 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  53.94 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  55.6 
 
 
235 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  54.58 
 
 
235 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  53.23 
 
 
264 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  54.02 
 
 
258 aa  256  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  53.14 
 
 
236 aa  252  6e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  51.35 
 
 
265 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  51.78 
 
 
258 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 
234 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.61 
 
 
257 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  52.85 
 
 
239 aa  248  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  54.03 
 
 
253 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  50.38 
 
 
257 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  49.81 
 
 
286 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  52.85 
 
 
239 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  54.03 
 
 
253 aa  246  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 
258 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  53.94 
 
 
235 aa  244  9e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  54.36 
 
 
235 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  49.23 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  53.14 
 
 
233 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  53.5 
 
 
236 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  52.48 
 
 
237 aa  242  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  52.07 
 
 
237 aa  241  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  51.81 
 
 
258 aa  241  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  50.42 
 
 
236 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  53.53 
 
 
254 aa  240  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  52.67 
 
 
236 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  52.26 
 
 
239 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  50.42 
 
 
234 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  52.23 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  52.3 
 
 
233 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  52.5 
 
 
234 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 
234 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  49.79 
 
 
237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  48.96 
 
 
257 aa  235  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  51.02 
 
 
238 aa  234  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  50.61 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  52.08 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  50.21 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  53.09 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  52.46 
 
 
238 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
247 aa  232  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  53.14 
 
 
235 aa  232  6e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  50.83 
 
 
238 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  48.96 
 
 
235 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>