More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0219 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  96.31 
 
 		 271 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  85.07 
 
 		 291 aa  481  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  82.96 
 
 		 267 aa  463  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  78.07 
 
 		 270 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  75.84 
 
 		 270 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  76.21 
 
 		 271 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  75.46 
 
 		 269 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  75.09 
 
 		 269 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  74.72 
 
 		 269 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  75.93 
 
 		 274 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  76.21 
 
 		 274 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  73.23 
 
 		 281 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  73.61 
 
 		 269 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  72.86 
 
 		 269 aa  410  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  74.07 
 
 		 274 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  74.07 
 
 		 267 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  74.07 
 
 		 276 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  73.7 
 
 		 278 aa  408  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  74.44 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  73.33 
 
 		 276 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  73.33 
 
 		 276 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  70.9 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  64.73 
 
 		 253 aa  328  8e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  62.55 
 
 		 264 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  56.88 
 
 		 263 aa  324  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  58.58 
 
 		 273 aa  322  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  65.15 
 
 		 258 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  58.21 
 
 		 272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  58.58 
 
 		 263 aa  317  9e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  57.62 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  57.84 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  57.09 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  60.52 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  59.33 
 
 		 279 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  59.7 
 
 		 279 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  59.33 
 
 		 279 aa  315  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  59.11 
 
 		 266 aa  315  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  57.25 
 
 		 266 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  54.48 
 
 		 283 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  59.7 
 
 		 280 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  58.58 
 
 		 279 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  62.04 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  57.46 
 
 		 279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  57.84 
 
 		 281 aa  308  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  55.97 
 
 		 272 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.83 
 
 		 257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  57.46 
 
 		 278 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  56.51 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  56.13 
 
 		 272 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  55.93 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  54.65 
 
 		 272 aa  298  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  54.44 
 
 		 270 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  54.65 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  58.96 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.72 
 
 		 258 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  57.84 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  56.68 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  58.02 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  56.56 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  53.11 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  52.63 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  50.58 
 
 		 265 aa  241  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  47.19 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.45 
 
 		 234 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  47.35 
 
 		 237 aa  228  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  45.32 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  44.57 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  46.07 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  46.5 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  48.13 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  47.74 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  49.18 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  47.13 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  46.47 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.72 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4420  ABC transporter related  46.89 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.15 
 
 		 239 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  47.76 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  45.87 
 
 		 238 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  47.33 
 
 		 239 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.28 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  49.38 
 
 		 235 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  48.76 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 		 234 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  45.9 
 
 		 238 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 		 238 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  46.53 
 
 		 237 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  48.76 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  46.28 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>