More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3612 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  91.45 
 
 		 269 aa  512  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  91.45 
 
 		 269 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  89.59 
 
 		 269 aa  500  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  89.51 
 
 		 281 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  89.22 
 
 		 269 aa  500  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  87.45 
 
 		 274 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  83.7 
 
 		 270 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  83.7 
 
 		 270 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  82.13 
 
 		 267 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  76.58 
 
 		 271 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  76.49 
 
 		 271 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  74.72 
 
 		 271 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  74.52 
 
 		 291 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  73.76 
 
 		 267 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  71.97 
 
 		 276 aa  404  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  70.04 
 
 		 274 aa  401  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  71.75 
 
 		 274 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  71.43 
 
 		 276 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  70.45 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  70.45 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  69.92 
 
 		 278 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  67.68 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  60.45 
 
 		 273 aa  336  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  59.7 
 
 		 299 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  60.23 
 
 		 265 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  59.16 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  60 
 
 		 264 aa  316  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 263 aa  315  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  58.4 
 
 		 279 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.54 
 
 		 260 aa  315  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  57.46 
 
 		 272 aa  314  8e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  58.4 
 
 		 279 aa  314  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  58.4 
 
 		 279 aa  314  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  56.3 
 
 		 266 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  58.4 
 
 		 280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  56.72 
 
 		 272 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  58.56 
 
 		 281 aa  311  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  55.93 
 
 		 266 aa  311  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  59.59 
 
 		 253 aa  311  9e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  56.06 
 
 		 263 aa  309  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  57.09 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  56.65 
 
 		 263 aa  304  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  55.51 
 
 		 263 aa  304  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  55.73 
 
 		 279 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  56.11 
 
 		 278 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.89 
 
 		 263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  55.85 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  54.17 
 
 		 272 aa  299  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  54.07 
 
 		 270 aa  298  7e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  58.09 
 
 		 272 aa  298  7e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  53.56 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  59.34 
 
 		 258 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  52.04 
 
 		 272 aa  295  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  50.94 
 
 		 283 aa  294  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.6 
 
 		 257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  55.6 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  55.68 
 
 		 276 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  56.25 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  55.83 
 
 		 253 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  55 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  50.62 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  50.62 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.76 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  45.86 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  43.94 
 
 		 286 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  45.21 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  47.08 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  45.83 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  47.72 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  44.26 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  48.15 
 
 		 236 aa  222  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  46.15 
 
 		 265 aa  222  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  47.93 
 
 		 242 aa  221  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  47.72 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  49.58 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  47.52 
 
 		 242 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  48.97 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  47.93 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  47.3 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  47.5 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.15 
 
 		 239 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  46.69 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  48.15 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  48.33 
 
 		 235 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  47.52 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  46.69 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  46.25 
 
 		 234 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4420  ABC transporter related  45.42 
 
 		 240 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  46.06 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  47.54 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  46.06 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  47.08 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  46.25 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  45.93 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>