More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0456 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  100 
 
 
269 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  98.88 
 
 
269 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  89.59 
 
 
269 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  89.22 
 
 
269 aa  500  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  89.73 
 
 
281 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  87.73 
 
 
269 aa  493  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  85.93 
 
 
274 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  82.59 
 
 
270 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  81.85 
 
 
270 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  80.75 
 
 
267 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  78.71 
 
 
271 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  74.35 
 
 
271 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  73.38 
 
 
291 aa  414  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  74.62 
 
 
276 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  73.61 
 
 
271 aa  414  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  73.03 
 
 
274 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  72.73 
 
 
274 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  70.68 
 
 
276 aa  400  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  72.35 
 
 
276 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  70.68 
 
 
276 aa  400  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  70.72 
 
 
267 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  71.21 
 
 
278 aa  394  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  68.06 
 
 
277 aa  384  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  61.19 
 
 
273 aa  335  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  60.07 
 
 
299 aa  325  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  57.41 
 
 
263 aa  324  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.45 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  59.54 
 
 
279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  58.78 
 
 
279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  58.33 
 
 
266 aa  319  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  59.92 
 
 
272 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  59.7 
 
 
281 aa  318  6e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  60.46 
 
 
265 aa  317  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  58.78 
 
 
279 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  58.78 
 
 
279 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  57.58 
 
 
263 aa  315  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  58.78 
 
 
280 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  57.58 
 
 
266 aa  315  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  56.11 
 
 
279 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  58.78 
 
 
272 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  59.54 
 
 
273 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  56.65 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  58.75 
 
 
264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  59.75 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  57.41 
 
 
263 aa  308  5e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  56.18 
 
 
276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  55.73 
 
 
278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  56.06 
 
 
272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.03 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  54.48 
 
 
269 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  60 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5290  ABC transporter related  52.09 
 
 
283 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  59.34 
 
 
258 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  54.17 
 
 
272 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  53.7 
 
 
270 aa  297  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1547  ABC transporter related protein  57.58 
 
 
276 aa  288  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 
258 aa  285  8e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  54.77 
 
 
258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.77 
 
 
257 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  55.42 
 
 
253 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  55.42 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  54.17 
 
 
254 aa  267  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  51.45 
 
 
257 aa  261  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  48.55 
 
 
266 aa  241  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  46.07 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.83 
 
 
234 aa  234  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  48.75 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  44.91 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  43.68 
 
 
286 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  49.39 
 
 
242 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.96 
 
 
235 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  49.39 
 
 
242 aa  228  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  48.98 
 
 
242 aa  228  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  51.32 
 
 
237 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  49.38 
 
 
235 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49.38 
 
 
236 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  44.76 
 
 
249 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.76 
 
 
235 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.17 
 
 
234 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  49.17 
 
 
241 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  51.75 
 
 
237 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  50.21 
 
 
236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  45.59 
 
 
258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  49.17 
 
 
236 aa  225  6e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  48.33 
 
 
241 aa  224  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  48.33 
 
 
241 aa  224  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  47.54 
 
 
248 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  49.17 
 
 
237 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  47.76 
 
 
259 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  48.33 
 
 
235 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  48.36 
 
 
239 aa  222  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  48.33 
 
 
233 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.77 
 
 
239 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  48.33 
 
 
238 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  46.15 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  48.33 
 
 
233 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  48.33 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  49.17 
 
 
234 aa  218  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  46.25 
 
 
234 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>