More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4710 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4710  ABC transporter related protein  100 
 
 		 236 aa  460  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  59.57 
 
 		 236 aa  264  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  55.79 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1743  ABC transporter related  55.56 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.244455  normal  0.0815205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3556  ABC transporter related  55.56 
 
 		 237 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4241  ABC transporter related  55.56 
 
 		 237 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 237 aa  248  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  55.98 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7077  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  52.79 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  51.71 
 
 		 237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 237 aa  234  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  55.04 
 
 		 241 aa  234  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  51.71 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  49.57 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  52.77 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  52.54 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  49.57 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  46.61 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  47.26 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.56 
 
 		 234 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  47.44 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  45.76 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.14 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  224  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  51.28 
 
 		 238 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  51.28 
 
 		 238 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.09 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  49.16 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  47.86 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  47.44 
 
 		 239 aa  221  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 244 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  53.81 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  53.78 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  48.74 
 
 		 247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  46.22 
 
 		 242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  52.14 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  44.87 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  46.61 
 
 		 237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  46.58 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  44.44 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  49.59 
 
 		 244 aa  218  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  46.19 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  48.32 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  51.05 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  49.58 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  51.05 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  51.68 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  45.73 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50.63 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  50.43 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  46.35 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  47.46 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  45.11 
 
 		 259 aa  214  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  214  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  47.06 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  52.14 
 
 		 234 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  50.42 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  47.01 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  50.43 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  44.44 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  51.06 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  50.85 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  49.36 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.11 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  45.11 
 
 		 238 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  45.11 
 
 		 238 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  49.37 
 
 		 246 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  45.99 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  46.15 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  49.58 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  46.64 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  45.8 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  48.51 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  44.68 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  44.68 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  44.92 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  44.92 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  44.26 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  44.26 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  44.26 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  49.58 
 
 		 240 aa  208  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  47.06 
 
 		 247 aa  208  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  48.33 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  46.58 
 
 		 244 aa  208  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 236 aa  208  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 238 aa  207  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 		 238 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 		 238 aa  207  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>