More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3101 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3101  ABC transporter related protein  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3818  ABC transporter related  52.92 
 
 
253 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0166098  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0672  ABC transporter related  55.51 
 
 
239 aa  249  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 
247 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  51.68 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  50.42 
 
 
247 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  50 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  50.84 
 
 
247 aa  239  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  51.26 
 
 
247 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  53.53 
 
 
247 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  52.54 
 
 
235 aa  236  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  51.04 
 
 
243 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  50.84 
 
 
247 aa  234  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.26 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.26 
 
 
239 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  51.48 
 
 
246 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1134  ABC transporter related  50 
 
 
243 aa  228  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.767247  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  49.15 
 
 
235 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  49.58 
 
 
242 aa  225  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  52.12 
 
 
264 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  48.74 
 
 
237 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  50.42 
 
 
235 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  47.9 
 
 
235 aa  222  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  48.73 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  45.61 
 
 
244 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  49.37 
 
 
234 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 
235 aa  219  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  50.42 
 
 
237 aa  219  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  50 
 
 
237 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  47.72 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  51.68 
 
 
237 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  47.7 
 
 
252 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.7 
 
 
236 aa  217  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  50.42 
 
 
234 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  47.88 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  50.85 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  49.58 
 
 
234 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  46.25 
 
 
253 aa  215  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  49.58 
 
 
249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  48.31 
 
 
234 aa  214  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  45.15 
 
 
247 aa  214  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  48.1 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  48.31 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  49.15 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  49.58 
 
 
830 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  49.58 
 
 
437 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  50.21 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1698  ABC transporter related  46.67 
 
 
242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  44.17 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  48.31 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  46.64 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  48.25 
 
 
255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  47.03 
 
 
270 aa  211  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  47.88 
 
 
238 aa  211  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  50 
 
 
234 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  46.22 
 
 
238 aa  211  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  48.32 
 
 
238 aa  211  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  47.03 
 
 
234 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  48.52 
 
 
235 aa  210  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  49.58 
 
 
234 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  47.68 
 
 
237 aa  210  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  47.48 
 
 
236 aa  210  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  44.49 
 
 
236 aa  209  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  46.91 
 
 
247 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  47.88 
 
 
237 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6451  ABC transporter related  46.19 
 
 
243 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104768  hitchhiker  0.0000000000233748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  45.8 
 
 
258 aa  209  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  47.03 
 
 
235 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1482  ABC transporter related  50.42 
 
 
234 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
234 aa  209  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  46.19 
 
 
236 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  48.73 
 
 
233 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  47.88 
 
 
248 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  47.26 
 
 
237 aa  208  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  46.5 
 
 
247 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  46.5 
 
 
247 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  47.5 
 
 
234 aa  208  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  47.46 
 
 
249 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  44.49 
 
 
237 aa  207  9e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 
234 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  45 
 
 
248 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  46.61 
 
 
233 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  48.52 
 
 
234 aa  207  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.5 
 
 
254 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6492  ABC transporter related  43.75 
 
 
244 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0130202  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  47.3 
 
 
238 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  48.31 
 
 
234 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
236 aa  206  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  45.76 
 
 
234 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  45.68 
 
 
247 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  47.46 
 
 
260 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  46.67 
 
 
252 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  48.31 
 
 
234 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  47.06 
 
 
236 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  43.33 
 
 
245 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  46.61 
 
 
257 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  46.09 
 
 
250 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.74 
 
 
238 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>