More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1698 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1698  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  78.01 
 
 		 245 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  76.67 
 
 		 251 aa  360  8e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6492  ABC transporter related  76.76 
 
 		 244 aa  360  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0130202  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  56.3 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 235 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  56.6 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  54.66 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.34 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  54.24 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  53.42 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  53.14 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  52.52 
 
 		 237 aa  244  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  52.12 
 
 		 236 aa  244  8e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  52.56 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  52.77 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  52.12 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 		 247 aa  242  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  48.32 
 
 		 237 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.79 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  53.16 
 
 		 239 aa  241  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 		 247 aa  241  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.89 
 
 		 239 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  50.41 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  49.58 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  54.62 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  52.56 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  54.04 
 
 		 264 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  51.71 
 
 		 235 aa  238  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  50.85 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 247 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 235 aa  238  8e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  52.14 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  48.35 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  49.58 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  53.75 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  55.13 
 
 		 236 aa  234  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  50.42 
 
 		 256 aa  234  7e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  51.9 
 
 		 237 aa  234  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  51.91 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  56.54 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  49.17 
 
 		 247 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  52.56 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  49.57 
 
 		 236 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  54.27 
 
 		 236 aa  232  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  52.74 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  51.06 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  51.91 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  51.49 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  53.62 
 
 		 234 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  52.14 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  53.53 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  49.15 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  51.06 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  50.64 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  51.9 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  50.64 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  52.12 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  51.91 
 
 		 246 aa  228  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  48.32 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  53.19 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  51.48 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  50.42 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  50.63 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  50 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  52.1 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  52.12 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  47.01 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  53.19 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  50.64 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  50.64 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  48.75 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  52.14 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  225  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  51.71 
 
 		 235 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  53.85 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  48.72 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  50.64 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  49.36 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  48.74 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  50.21 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  48.74 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  48.72 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  49.58 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  46.22 
 
 		 242 aa  222  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  49.15 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  48.51 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  50.42 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  48.29 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  46.31 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  47.66 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  48.09 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  48.29 
 
 		 235 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  48.95 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>