More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6451 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6451  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  483  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104768  hitchhiker  0.0000000000233748 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  50.85 
 
 		 239 aa  248  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50.43 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  53.65 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  53.65 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  48.93 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  53.22 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.21 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  50.85 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.71 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  46.78 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  46.81 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  51.71 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  51.93 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  46.58 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  52.14 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7593  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.14 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  46.78 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  46.78 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  46.35 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  47.03 
 
 		 237 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  46.38 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  46.35 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  45.92 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  45.92 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  50 
 
 		 244 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  47.44 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  52.36 
 
 		 242 aa  231  9e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.93 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  49.36 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.66 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  48.07 
 
 		 234 aa  228  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  47.21 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  47.23 
 
 		 238 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  48.95 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.07 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  48.31 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  49.37 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  46.38 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45.92 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  48.52 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  49.15 
 
 		 265 aa  222  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  48.72 
 
 		 264 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  48.29 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  48.39 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  45.3 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.11 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  47.08 
 
 		 254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0098  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.64 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  47.5 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  49.36 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  47.3 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  48.5 
 
 		 242 aa  218  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3977  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.72 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.099286  decreased coverage  0.00201124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  46.69 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  46.69 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  48.29 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  46.78 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  48.5 
 
 		 234 aa  218  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 		 233 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  45.73 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4420  ABC transporter related  48.1 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  47.88 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  47.01 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  48.29 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  46.78 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1317  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.93 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  45.49 
 
 		 238 aa  215  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  48.94 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  47.86 
 
 		 237 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  49.37 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  48.94 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  48.5 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  47.5 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>