More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1317 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1317  ABC transporter related protein  100 
 
 
238 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3804  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
247 aa  261  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  48.74 
 
 
239 aa  245  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  48.94 
 
 
259 aa  244  9e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  47.06 
 
 
239 aa  238  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  47.01 
 
 
236 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  48.09 
 
 
235 aa  235  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
234 aa  234  6e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  48.07 
 
 
234 aa  231  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  49.36 
 
 
237 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 
234 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  46.38 
 
 
237 aa  228  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  48.07 
 
 
236 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  47.21 
 
 
235 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  47.64 
 
 
233 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  47.21 
 
 
235 aa  224  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  47.84 
 
 
237 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49.15 
 
 
236 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  49.57 
 
 
235 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  47.01 
 
 
237 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 
247 aa  222  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  46.78 
 
 
234 aa  222  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  47.26 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  49.17 
 
 
247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  44.64 
 
 
235 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  45.92 
 
 
234 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  46.55 
 
 
238 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  49.57 
 
 
243 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  45.06 
 
 
236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  49.17 
 
 
247 aa  218  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  47.86 
 
 
235 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  45.96 
 
 
238 aa  218  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  49.58 
 
 
247 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  48.29 
 
 
236 aa  218  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  46.64 
 
 
247 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  46.64 
 
 
247 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  51.57 
 
 
502 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  46.64 
 
 
247 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6451  ABC transporter related  45.96 
 
 
243 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104768  hitchhiker  0.0000000000233748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  46.58 
 
 
237 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45.92 
 
 
234 aa  216  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  45.57 
 
 
243 aa  215  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.11 
 
 
237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  43.78 
 
 
234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.35 
 
 
235 aa  214  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
233 aa  214  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  46.35 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  44.3 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  48.72 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  47.7 
 
 
238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  44.64 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  46.35 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  44.21 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3818  ABC transporter related  45.34 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0166098  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  48.07 
 
 
256 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  48.72 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  49.36 
 
 
244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  45.92 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  46.22 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  46.15 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  43.88 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  47.93 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.57 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  44.96 
 
 
252 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  45.57 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  45.57 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.79 
 
 
233 aa  211  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.02 
 
 
236 aa  211  7e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  48.52 
 
 
240 aa  211  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  46.41 
 
 
238 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  45.06 
 
 
236 aa  211  7e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  48.43 
 
 
501 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.67 
 
 
254 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  45.3 
 
 
235 aa  211  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  47.48 
 
 
247 aa  211  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.79 
 
 
233 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  48.5 
 
 
242 aa  210  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.16 
 
 
243 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.52 
 
 
237 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  44.64 
 
 
233 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.52 
 
 
237 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.52 
 
 
237 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.52 
 
 
237 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.52 
 
 
237 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  43.35 
 
 
237 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  46.98 
 
 
237 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  44.68 
 
 
235 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2492  ATPase  46.41 
 
 
237 aa  209  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  44.58 
 
 
257 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  45.92 
 
 
234 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  45.76 
 
 
239 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  46.78 
 
 
235 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  42.31 
 
 
237 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  46.86 
 
 
238 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>