More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1134 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1134  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.767247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  55.14 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  55.87 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  56.28 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  54.66 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  53.44 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  53.44 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  55.13 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  51.42 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  52.99 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.56 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 237 aa  248  8e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  52.14 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.48 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  51.06 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50.63 
 
 		 239 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  47.88 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  50.83 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  48.31 
 
 		 236 aa  235  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 236 aa  234  8e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  50.85 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  49.57 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  50.43 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  50.62 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  51.43 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  48.51 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  50.85 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  49.15 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  49.58 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  50.85 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3101  ABC transporter related protein  50 
 
 		 241 aa  228  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3977  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 235 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.099286  decreased coverage  0.00201124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  50.21 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  48.1 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  49.57 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  45.73 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  47.23 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  53.85 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  48.72 
 
 		 233 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  48.51 
 
 		 235 aa  225  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0837  ABC transporter-related protein  51.43 
 
 		 245 aa  224  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  51.91 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3657  ABC transporter related  48.94 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  46.58 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  50.43 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  50.42 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  51.49 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  49.57 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.51 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  51.06 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  50.43 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  49.58 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 238 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  51.28 
 
 		 238 aa  221  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3818  ABC transporter related  47.5 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0166098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  48.29 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  50.43 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  50.42 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  51.06 
 
 		 243 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.72 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  52.34 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  49.16 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2492  ATPase  51.49 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  46.58 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  45.73 
 
 		 265 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  49.16 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  48.29 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  49.16 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  49.16 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  48.94 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  48.72 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  48.29 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  48.5 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  50.64 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  48.12 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  44.68 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.16 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  46.61 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  47.66 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  48.29 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  48.74 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  47.44 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>