34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2374 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  361  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  361  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  40.33 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  31.11 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  31.67 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  30.59 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  38.51 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  38.51 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  38.51 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  33.33 
 
 		 682 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  36.05 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  36.43 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  31.11 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  32.53 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  28.25 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  30.41 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12820  hypothetical protein  32.93 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270061  decreased coverage  0.00529228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  29.28 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  32.14 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  31.28 
 
 		 340 aa  54.7  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  31.77 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  33.86 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  29.82 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.7 
 
 		 719 aa  51.2  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2973  hypothetical protein  32.28 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  32.56 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  27.22 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  28 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  28.72 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  29.07 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  28.8 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  32.82 
 
 		 199 aa  44.7  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  29.17 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>