35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1119 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  390  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  58.6 
 
 
195 aa  220  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  53.89 
 
 
203 aa  171  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  55 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  42.59 
 
 
210 aa  121  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  44.52 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  40.38 
 
 
193 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2973  hypothetical protein  38.19 
 
 
195 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  37.93 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  37.93 
 
 
185 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  37.93 
 
 
185 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  32.91 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  33.69 
 
 
204 aa  92  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  36.17 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  35.82 
 
 
682 aa  88.2  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.37 
 
 
719 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  28.25 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  34.83 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  27.68 
 
 
198 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2856  hypothetical protein  31.41 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  32.89 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  26.35 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  31.9 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  28.64 
 
 
340 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  30.05 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  27.52 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12820  hypothetical protein  32.34 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270061  decreased coverage  0.00529228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  29.71 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  28.25 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  28.25 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  30.6 
 
 
226 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  27.17 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  32.79 
 
 
221 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  30.67 
 
 
207 aa  42  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>