40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6582 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  373  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  42.54 
 
 
195 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  42.71 
 
 
204 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  46.15 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  49.38 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  44.79 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  45.74 
 
 
221 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  42.41 
 
 
340 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  40.38 
 
 
190 aa  112  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  46.07 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  43.92 
 
 
199 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  45.57 
 
 
156 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  39.52 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  30.81 
 
 
198 aa  95.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  30.23 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  33.51 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  36.41 
 
 
191 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  39.53 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  39.53 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  39.53 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  40.83 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2973  hypothetical protein  39.13 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  29.81 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.51 
 
 
719 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  39.24 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  35.63 
 
 
682 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2856  hypothetical protein  35.8 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  32.76 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  32.53 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  32.53 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  33.54 
 
 
170 aa  51.6  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  34.16 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  25.54 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  27.46 
 
 
554 aa  48.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  27.81 
 
 
529 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12820  hypothetical protein  35.54 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270061  decreased coverage  0.00529228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0433  adenylate kinase  23.45 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553911  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  26.39 
 
 
207 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  25.73 
 
 
557 aa  42.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  22.97 
 
 
551 aa  41.6  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>