41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3927 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  86.36 
 
 		 221 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  46.07 
 
 		 193 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  40.62 
 
 		 204 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  43.5 
 
 		 210 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  39.01 
 
 		 195 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  44 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  44.51 
 
 		 199 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  43.16 
 
 		 184 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  40.96 
 
 		 156 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  38.92 
 
 		 203 aa  86.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  41.8 
 
 		 188 aa  86.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  30.15 
 
 		 190 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  38.18 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  26.4 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  33.95 
 
 		 682 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  27.37 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  30.43 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2973  hypothetical protein  37.95 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  33.52 
 
 		 191 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.14 
 
 		 719 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  35.29 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  34.13 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  34.13 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  29.53 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  35.33 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2856  hypothetical protein  36.99 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43015  predicted protein  33.33 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239566  hitchhiker  0.00935325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  33.11 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  33.33 
 
 		 195 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  32.95 
 
 		 170 aa  52.8  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  26.21 
 
 		 207 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  31.22 
 
 		 182 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  31.22 
 
 		 182 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  21.16 
 
 		 193 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  35.82 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  24.3 
 
 		 557 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  20.11 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  22.84 
 
 		 554 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.45 
 
 		 555 aa  43.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  21.66 
 
 		 217 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>