24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0338 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  40.33 
 
 
182 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  40.33 
 
 
182 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  32 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  34.87 
 
 
180 aa  62.4  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  36.79 
 
 
340 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  33.73 
 
 
204 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  27.93 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  32.16 
 
 
199 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  33.81 
 
 
188 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  36.51 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  30.6 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  26.88 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  34.16 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  25.53 
 
 
198 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  33.15 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  29.26 
 
 
195 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.9 
 
 
555 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  30.33 
 
 
193 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  29.76 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  32.22 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.57 
 
 
343 aa  41.6  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  24.86 
 
 
198 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>