49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22250 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  58.6 
 
 		 190 aa  220  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  54.12 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  56.73 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  45.7 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  42.54 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  47.56 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  40.12 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  41.84 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  42.28 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  42.28 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  42.28 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2973  hypothetical protein  41.78 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  33.53 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  38.46 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  32.39 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  39.01 
 
 		 221 aa  98.2  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  32.53 
 
 		 682 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  38.95 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.75 
 
 		 719 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2856  hypothetical protein  35.59 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  32.1 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  37.71 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  33.52 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  36.77 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  31.33 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  31.55 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  32.08 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12820  hypothetical protein  28.83 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270061  decreased coverage  0.00529228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  30.29 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  29.26 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.68 
 
 		 683 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2827  topology modulation protein  38.46 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2605  topology modulation protein  36.92 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0299285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2794  topology modulation protein  36.92 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2524  topology modulation protein  36.92 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.406139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2557  topology modulation protein  36.92 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0695559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2803  topology modulation protein  38.46 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2602  topology modulation protein  42 
 
 		 172 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2848  topology modulation protein  42 
 
 		 167 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0419175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2484  topology modulation protein  42.86 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892962  normal  0.805608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2806  topology modulation protein  42.86 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1613  putative DNA topology modulation kinase FlaR-like protein  47.27 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  29.17 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3951  topology modulation protein  45.65 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.874526  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1718  putative DNA topology modulation protein FlaR  23.48 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3219  hypothetical protein  32.89 
 
 		 175 aa  42  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>