46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3552 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  431  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  86.36 
 
 		 340 aa  338  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  49.47 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  40.5 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  45.56 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  45.71 
 
 		 180 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  39.56 
 
 		 195 aa  113  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  47.8 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  41.99 
 
 		 184 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  43.37 
 
 		 156 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  38.32 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  43.55 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  41.82 
 
 		 196 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  31.61 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  34.9 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  26.4 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  33.95 
 
 		 682 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  31.9 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  25.84 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2973  hypothetical protein  37.35 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  30.05 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.14 
 
 		 719 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  33.52 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  33.52 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  33.52 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2856  hypothetical protein  36.56 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  34.1 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  32.92 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43015  predicted protein  31.08 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239566  hitchhiker  0.00935325 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  32.22 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  35.76 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  27.59 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.13 
 
 		 555 aa  49.3  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  20.9 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  29.1 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  29.1 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  25.85 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  25.85 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  20.79 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  21.99 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3008  uridine kinase  20.9 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  34.33 
 
 		 447 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  20.53 
 
 		 193 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  19.86 
 
 		 205 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  28.57 
 
 		 211 aa  42  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  25 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>