33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2973 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2973  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  40.36 
 
 
195 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  36.31 
 
 
190 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  44.44 
 
 
682 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  46.9 
 
 
185 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  46.9 
 
 
185 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  46.9 
 
 
185 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.21 
 
 
719 aa  101  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  46.71 
 
 
170 aa  101  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  45.16 
 
 
196 aa  98.6  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  43.87 
 
 
210 aa  94  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  43.54 
 
 
193 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  41.88 
 
 
184 aa  91.7  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  41.67 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  39.52 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  42.58 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12820  hypothetical protein  45.34 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270061  decreased coverage  0.00529228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2856  hypothetical protein  39.77 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  35.71 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  29.8 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  36.41 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  35.91 
 
 
340 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  28.48 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  34.25 
 
 
221 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  28.57 
 
 
198 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  34.12 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  30.86 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  26.06 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  30.61 
 
 
204 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  23.4 
 
 
208 aa  42  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  31.65 
 
 
182 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  31.65 
 
 
182 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  27.21 
 
 
211 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>