67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2709 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  100 
 
 
225 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  60.45 
 
 
230 aa  243  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  55.5 
 
 
268 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  46.26 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  46.5 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  44.17 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  36.07 
 
 
223 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  46.27 
 
 
222 aa  141  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  36.41 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  35.62 
 
 
223 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  34.4 
 
 
223 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  35.62 
 
 
223 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  34.26 
 
 
220 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  39.64 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  37.24 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  34.84 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  43.04 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  41.54 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  38.25 
 
 
223 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2744  hypothetical protein  42.72 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  24.37 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  39.86 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  28.9 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  24.87 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  32.82 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  24.88 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  23.87 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  23.87 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  31.6 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  28.57 
 
 
204 aa  58.9  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  33.99 
 
 
209 aa  58.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  36.76 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  22.53 
 
 
198 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2745  hypothetical protein  52 
 
 
154 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  34.71 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  27.8 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  29.33 
 
 
213 aa  52.4  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  31.35 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  31.35 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  27.23 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  21.62 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  20.92 
 
 
191 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  33.51 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2807  uridine kinase  23.35 
 
 
189 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.560437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  30.33 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  26.25 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  31.66 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  33.55 
 
 
213 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  28.79 
 
 
232 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  31.9 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  23.56 
 
 
193 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  22.12 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  22.12 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  24.88 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  25.52 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  28.12 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  23.62 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  29.53 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  23.62 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  28.28 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  30.3 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  27.59 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  22.71 
 
 
193 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  27.43 
 
 
315 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3007  uridine kinase  22.12 
 
 
193 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  51.06 
 
 
250 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  27.72 
 
 
213 aa  42  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>