More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1209 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  484  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  85.94 
 
 		 249 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  73.28 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  68.95 
 
 		 250 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  59.35 
 
 		 250 aa  289  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  55.65 
 
 		 250 aa  271  9e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  55.92 
 
 		 251 aa  268  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  55.95 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  55.87 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  56.28 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  53.69 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  53.54 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  53.85 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  53.91 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  51.63 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  52.03 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  50.62 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  52.02 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  50.81 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  56.15 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  53.01 
 
 		 264 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  53.28 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  48.79 
 
 		 253 aa  231  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  49.59 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  52.48 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  45.75 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  47.95 
 
 		 254 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  52.42 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  50.2 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  48.79 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  48.78 
 
 		 250 aa  224  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  45.93 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  48.58 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  50 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  47.74 
 
 		 252 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  47.39 
 
 		 859 aa  218  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  47.11 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  52.23 
 
 		 249 aa  214  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  47.58 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  48.76 
 
 		 842 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  46.25 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  49.18 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  42.17 
 
 		 249 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  48.16 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  41.37 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  41.37 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  47.74 
 
 		 597 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  47.35 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  42.86 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  45.93 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  44.27 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  45.87 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  44.31 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  43.85 
 
 		 266 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.75 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  42.68 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  47.15 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  44.31 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  43.85 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  44.17 
 
 		 632 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  43.44 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  41.63 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.87 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  44.81 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  44.84 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  46.28 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  41.39 
 
 		 250 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  45.3 
 
 		 273 aa  194  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  40.98 
 
 		 251 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.31 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  43.27 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  42.32 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  44 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  43.72 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  38.93 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  41.7 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  46.56 
 
 		 594 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  45.45 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  45.57 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  41.63 
 
 		 255 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  43.37 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  45.49 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  45.3 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  42.51 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  43.27 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  42.45 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  40.32 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  47.74 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  44.68 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  44.35 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>