26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0839 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  39.32 
 
 
208 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  36.23 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  41.46 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  37.32 
 
 
214 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  36.06 
 
 
209 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  40.1 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  41.46 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  39.02 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  36.97 
 
 
248 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  32.96 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  37.07 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  33.57 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  37.19 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  28.79 
 
 
223 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  28.79 
 
 
223 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  28.79 
 
 
223 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  29.41 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  27.41 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  28.03 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  34.93 
 
 
268 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  27.73 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  31.3 
 
 
231 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  27.27 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  33.72 
 
 
164 aa  45.1  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  32.17 
 
 
250 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>