28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1177 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  43.92 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  39.32 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  41.84 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  44.76 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  41.43 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  35.78 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  37.85 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  43.06 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  30.77 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  37.12 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  24 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  38.17 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  22.61 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  33.56 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  31.58 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  24.07 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  23.5 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  24.38 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  24.38 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  22.68 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  25.75 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  33.99 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  23.96 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  28.22 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  27.61 
 
 		 250 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  28.16 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  26.4 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>