43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0330 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0330  uridine kinase-like  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0269818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0659  phosphoribulokinase/uridine kinase  72.73 
 
 		 237 aa  337  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1431  phosphoribulokinase/uridine kinase  63.43 
 
 		 219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2184  phosphoribulokinase/uridine kinase  62.56 
 
 		 233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0173  uridine kinase-like protein  62.96 
 
 		 219 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0052  uridine kinase-like  54.01 
 
 		 193 aa  198  6e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  26.29 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  22.75 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  22.92 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  23.16 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.85 
 
 		 558 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  22.93 
 
 		 553 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3621  uridine kinase  24.34 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.66 
 
 		 557 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  26.35 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  23.31 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  21.57 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  21.57 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.27 
 
 		 325 aa  45.8  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  21.8 
 
 		 504 aa  45.8  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  24.44 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  23.94 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.91 
 
 		 384 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.91 
 
 		 385 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.91 
 
 		 385 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.55 
 
 		 559 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  26.67 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  23.61 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  21.01 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  21.01 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  24.18 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  27.96 
 
 		 384 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  24.6 
 
 		 547 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  40.98 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  39.29 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  19.66 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45513  predicted protein  20.87 
 
 		 381 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011186  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  38.46 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  26.02 
 
 		 557 aa  42.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  25 
 
 		 555 aa  42  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  25 
 
 		 555 aa  42  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.16 
 
 		 462 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0995  uridine kinase  28.81 
 
 		 197 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0443185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>