285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2240 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 384 aa  738    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  83.33 
 
 		 385 aa  595  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  83.06 
 
 		 384 aa  592  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  83.06 
 
 		 385 aa  591  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  78.8 
 
 		 382 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  78.53 
 
 		 382 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  60.33 
 
 		 398 aa  391  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  56.83 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  55.74 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  58.36 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  54.64 
 
 		 379 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  55.31 
 
 		 385 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  54.49 
 
 		 378 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  55.25 
 
 		 379 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  55.83 
 
 		 379 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  50.27 
 
 		 391 aa  332  9e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  50.41 
 
 		 374 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  56.98 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  50.68 
 
 		 374 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  50.14 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  53.01 
 
 		 412 aa  313  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  50.82 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  51.78 
 
 		 409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  50.27 
 
 		 384 aa  305  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  50 
 
 		 387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  44.14 
 
 		 378 aa  268  8e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  49.31 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  46.95 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  46.88 
 
 		 357 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  41.46 
 
 		 375 aa  236  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  43.21 
 
 		 363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  42.78 
 
 		 357 aa  233  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  42.93 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  43.21 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  41.05 
 
 		 361 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  46.61 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  44.41 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  42.74 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  40.66 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  43.26 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  41.93 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  28.45 
 
 		 372 aa  172  5.999999999999999e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  28.45 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  26.87 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  29.13 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.7 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.96 
 
 		 376 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.06 
 
 		 386 aa  122  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.43 
 
 		 372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  29.01 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0003  recombination protein F  28 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000843052  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.9 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.43 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  25.63 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.68 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.08 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0003  recombination protein F  27.75 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.801088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0003  DNA replication and repair protein RecF  26.43 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167718  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.43 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.47 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  30.63 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0003  DNA replication and repair protein  26.43 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0109066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.25 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0003  recombination protein F  31.03 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0385213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0003  recombination protein F  30.75 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0661286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.14 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.86 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.795799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.1 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.98 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  26.12 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  30.14 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0053  DNA replication and repair protein RecF  31.71 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00030  recombination protein F  28.22 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0003  recombination protein F  28.22 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  25.42 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  29.31 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0138  recombination protein F  26.69 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  26.67 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  24.38 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0003  recombination protein F  29.02 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0110624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.98 
 
 		 374 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0003  recombination protein F  27.07 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.53 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  20.94 
 
 		 362 aa  97.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0005  recombination protein F  27.67 
 
 		 367 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0003  recombination protein F  27.84 
 
 		 367 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  23.16 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  23.16 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4225  recombination protein F  28.57 
 
 		 357 aa  96.3  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164466  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  23.72 
 
 		 377 aa  96.3  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  23.16 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.57 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.877523  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03527  hypothetical protein  28.57 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.73 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3913  recombination protein F  28.57 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00221081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4210  recombination protein F  28.57 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000837842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5128  recombination protein F  28.57 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.010515  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4065  recombination protein F  28.57 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0837895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0003  recombination protein F  28.57 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0566679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  23.16 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>