More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0003 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0003  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 382 aa  766    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  35.48 
 
 		 370 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  31.81 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  32.44 
 
 		 365 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  29.34 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.68 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.04 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  32.4 
 
 		 375 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  31.93 
 
 		 365 aa  172  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  33.77 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.78 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000176519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.34 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  30.21 
 
 		 374 aa  169  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.93 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  29.87 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0003  RecF recombinational DNA repair ATPase  30.68 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0003  RecF recombinational DNA repair ATPase  30.68 
 
 		 353 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  29.21 
 
 		 370 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  29.21 
 
 		 370 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  31.42 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  31.27 
 
 		 375 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  31.27 
 
 		 375 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  31.27 
 
 		 375 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  31.27 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  31.27 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  31.27 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  31 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  31 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  31 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  31 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  29.79 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  30.89 
 
 		 373 aa  156  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  29.74 
 
 		 371 aa  155  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.72 
 
 		 373 aa  155  8e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  31.92 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.56 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.64 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  33.8 
 
 		 370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0008  recombination protein F  29.82 
 
 		 360 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0621721  hitchhiker  0.00000000274736 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.2 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  30.77 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.26 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.93 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00030  recombination protein F  30.81 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0003  recombination protein F  29.95 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0384357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  31.37 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  29.12 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0003  recombination protein F  29.58 
 
 		 360 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0188151  hitchhiker  0.0000523089 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  29.3 
 
 		 378 aa  149  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.32 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  30.08 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.61 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  24.38 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0003  recombination protein F  32.35 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0661286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00030  recombination protein F  29.26 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  30.48 
 
 		 361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0003  recombination protein F  28.79 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  28.77 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0003  recombination protein F  31.2 
 
 		 361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0110624  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  32.34 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0003  recombination protein F  28.8 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.801088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0003  recombination protein F  28.76 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.98 
 
 		 372 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0138  recombination protein F  29.92 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  31.91 
 
 		 392 aa  146  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0003  recombination protein F  28.8 
 
 		 365 aa  145  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00186248  hitchhiker  0.000000180359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3716  DNA replication and repair protein RecF  27.78 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0034  recombination protein F  32.27 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000927918  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.65 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0003  recombination protein F  31.18 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0385213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  32.63 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.74 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 372 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00444  recombination protein F  29.25 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  27.78 
 
 		 365 aa  143  6e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  25.69 
 
 		 361 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  25.69 
 
 		 361 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0011  recombination protein F  30.62 
 
 		 359 aa  143  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10983  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.54 
 
 		 358 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  29.58 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002007  DNA recombination and repair protein RecF  28.69 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0003677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2505  recombination protein F  28.87 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0488541  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0005  recombination protein F  28.39 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  29.18 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  33.88 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  32.01 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  30.59 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0003  recombination protein F  28.08 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.47 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  30.42 
 
 		 360 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0003  recombination protein F  30.49 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000843052  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0003  recombination protein F  30.13 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0003  recombination protein F  28.12 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113705  normal  0.121048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.07 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4175  recombination protein F  30.13 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0239408  normal  0.0132322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0012  recombination protein F  28.12 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  28.17 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  28.17 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  31.46 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4065  recombination protein F  29.07 
 
 		 357 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0837895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>