More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0003 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0003  recombination protein F  100 
 
 		 384 aa  763    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  99.48 
 
 		 384 aa  758    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  92.41 
 
 		 387 aa  666    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  64.4 
 
 		 391 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  59.52 
 
 		 374 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  59.25 
 
 		 374 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  59.52 
 
 		 374 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  57.84 
 
 		 378 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  57.87 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  52.96 
 
 		 412 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  51.46 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  50.81 
 
 		 378 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  50.81 
 
 		 378 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  50.54 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  51.21 
 
 		 379 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  50.13 
 
 		 382 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  50.27 
 
 		 385 aa  333  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  49.6 
 
 		 385 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  50.53 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  50.54 
 
 		 384 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  51.51 
 
 		 384 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  48.01 
 
 		 382 aa  318  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  52.02 
 
 		 356 aa  319  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  52.02 
 
 		 379 aa  316  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  49.2 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  47.94 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  49.46 
 
 		 363 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  49.18 
 
 		 368 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  48.37 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  48.37 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  44.88 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.78 
 
 		 384 aa  262  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  44.44 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  45.71 
 
 		 357 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  44.54 
 
 		 375 aa  257  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  47.57 
 
 		 357 aa  256  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  45.18 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  43.78 
 
 		 369 aa  247  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  43.44 
 
 		 392 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  41.85 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  40.22 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  30.95 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  29.48 
 
 		 365 aa  179  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  29.87 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  31.83 
 
 		 349 aa  155  2e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  30.11 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  29.68 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.8 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  27.01 
 
 		 369 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  29.7 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.71 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  25.33 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  22.56 
 
 		 362 aa  121  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  29.02 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  29.02 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  27.54 
 
 		 367 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  29.02 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  29.02 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.61 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0003  recombination protein F  27.97 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0188151  hitchhiker  0.0000523089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  27.17 
 
 		 359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.52 
 
 		 382 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1225  DNA replication and repair protein RecF  31.56 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.193168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  28.12 
 
 		 360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.59 
 
 		 372 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  26.7 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.25 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0003  recombination protein F  27.2 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.029356  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.88 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.56 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  29.07 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  26.93 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0011  recombination protein F  27.2 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.32 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  26.32 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0003  recombination protein F  26.93 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.316978  hitchhiker  0.00705664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  28.5 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  24.4 
 
 		 361 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  24.4 
 
 		 361 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.03 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0003  recombination protein F  26.93 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000843052  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  25.75 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.88 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  29.59 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  28.65 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  28.65 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  28.65 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002007  DNA recombination and repair protein RecF  26.34 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0003677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.33 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  28.13 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  29.59 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  28.65 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  28.65 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0003  recombination protein F  27.44 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00186248  hitchhiker  0.000000180359 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  28.65 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  26.2 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.77 
 
 		 369 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  29.31 
 
 		 364 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.77 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  25.73 
 
 		 374 aa  109  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>