284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1277 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  100 
 
 		 378 aa  772    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  54.93 
 
 		 391 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  57.84 
 
 		 384 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  56.84 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  57.3 
 
 		 384 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  50.93 
 
 		 374 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  51.48 
 
 		 374 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  50.95 
 
 		 374 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  50.67 
 
 		 409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  47.7 
 
 		 379 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  46.93 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  46.13 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  45.87 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  47.99 
 
 		 412 aa  305  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  46.76 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.77 
 
 		 382 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.77 
 
 		 382 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  44.99 
 
 		 378 aa  291  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  44.41 
 
 		 385 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.65 
 
 		 384 aa  289  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  44.15 
 
 		 385 aa  289  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  46.28 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  44.14 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  44.71 
 
 		 398 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  42.97 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  44.26 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  43.85 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  44.12 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  43.75 
 
 		 363 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  43.17 
 
 		 361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  42.37 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  41.62 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  40.58 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  41.76 
 
 		 357 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  39.13 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  42.7 
 
 		 403 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  39.39 
 
 		 357 aa  229  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  41.26 
 
 		 369 aa  225  9e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  39.06 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  41.3 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  39.67 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  30.56 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  29.71 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  30.14 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  28.84 
 
 		 369 aa  136  8e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  30 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  29.03 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.27 
 
 		 386 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  26.27 
 
 		 373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  29.52 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  26.72 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.88 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.15 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00030  recombination protein F  26.65 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  28.33 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.52 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0003  recombination protein F  26.65 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  26.54 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  27.14 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.53 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.14 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  28.57 
 
 		 370 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  25.57 
 
 		 375 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  25.34 
 
 		 375 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  25 
 
 		 375 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  21.19 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0003  recombination protein F  27.56 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  24.73 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  24.73 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  29.01 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  27.17 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  28.25 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0003  recombination protein F  26.26 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  27.11 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  25.65 
 
 		 374 aa  102  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  27.53 
 
 		 371 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00005  Recombinational DNA repair ATPase  27.35 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000571812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0005  recombination protein F  25.52 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0003  recombination protein F  26.26 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.801088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.27 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0003  recombination protein F  25.99 
 
 		 367 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113705  normal  0.121048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0012  recombination protein F  25.99 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.87 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  25.63 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  25.2 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.85 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.98 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0003  recombination protein F  25.07 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  25.59 
 
 		 360 aa  96.3  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  24.4 
 
 		 360 aa  95.9  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  25.74 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  26.67 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  26.94 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.45 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  25.96 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>