281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0158 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  100 
 
 		 392 aa  762    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  52.86 
 
 		 412 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  46.56 
 
 		 374 aa  269  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  48.91 
 
 		 356 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  47.66 
 
 		 391 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  44.94 
 
 		 374 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  49.61 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  46.26 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  44.97 
 
 		 374 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  47.35 
 
 		 409 aa  253  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  47.12 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  42.71 
 
 		 375 aa  249  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  47.84 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  46.82 
 
 		 368 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  45.65 
 
 		 378 aa  246  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  44.36 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  45.5 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  47.29 
 
 		 369 aa  239  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  44.65 
 
 		 378 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  43.85 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  43.73 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  43.48 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  40.58 
 
 		 378 aa  234  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  42.64 
 
 		 398 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  42.11 
 
 		 385 aa  232  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  42.93 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  44.44 
 
 		 358 aa  229  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  43.12 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.6 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  43.65 
 
 		 384 aa  226  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  43.12 
 
 		 357 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  41.8 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  40.96 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  42.74 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  43.43 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  41.44 
 
 		 382 aa  209  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  40.58 
 
 		 382 aa  206  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  44.05 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  41.76 
 
 		 379 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  41.71 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  42.25 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  30.33 
 
 		 372 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  30.16 
 
 		 365 aa  163  6e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  29.78 
 
 		 372 aa  162  9e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  29.76 
 
 		 349 aa  133  6.999999999999999e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.51 
 
 		 372 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.25 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.1 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  25.26 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.92 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.93 
 
 		 372 aa  99.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  31.38 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.47 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.67 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  29.82 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0018  RecF protein  26.76 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.86 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  28.65 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0003  recombination protein F  27.96 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.801088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.51 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  31.52 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  31.52 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.96 
 
 		 367 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  23.76 
 
 		 362 aa  93.6  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  28.61 
 
 		 365 aa  92.8  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  25.9 
 
 		 370 aa  92.8  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0003  DNA replication and repair protein RecF  26.17 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167718  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0003  DNA replication and repair protein  26.17 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0109066  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  31.51 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  24.73 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0003  recombination protein F  28.46 
 
 		 367 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.67 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00005  Recombinational DNA repair ATPase  25.95 
 
 		 338 aa  89.7  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000571812  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  29.41 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  27.69 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  30.61 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.68 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.07 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.2 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0003  recombination protein F  28.11 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0005  recombination protein F  28.57 
 
 		 367 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00030  recombination protein F  28.69 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  25.82 
 
 		 367 aa  86.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0003  recombination protein F  28.69 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0011  recombination protein F  24.11 
 
 		 360 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0003  recombination protein F  24.8 
 
 		 360 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.316978  hitchhiker  0.00705664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  24.38 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0003  recombination protein F  24.11 
 
 		 360 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.029356  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  25.47 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  25.47 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0012  recombination protein F  27.84 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0003  recombination protein F  28.34 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.75 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0752559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  27.32 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.33 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.89 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0008  recombination protein F  25.81 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0621721  hitchhiker  0.00000000274736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00030  recombination protein F  29.12 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  24.38 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0003  recombination protein F  27.57 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113705  normal  0.121048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>