276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0199 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 349 aa  723    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  32.6 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  32.58 
 
 		 412 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  31.65 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  32.29 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  32.39 
 
 		 384 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  32.39 
 
 		 384 aa  156  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  30.91 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  30.99 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  30.53 
 
 		 378 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  30.66 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  31.18 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  31.4 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.05 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  30.26 
 
 		 379 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  31.55 
 
 		 387 aa  149  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  31.61 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  30.11 
 
 		 357 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  30.55 
 
 		 378 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.23 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  29.94 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  30 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  30 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  30 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  30.25 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  29.78 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  31.18 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  29.48 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  27.25 
 
 		 375 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.89 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  31.99 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  30.81 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  28.77 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  29.51 
 
 		 365 aa  136  5e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  30.57 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  31.27 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  29.92 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  29.39 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  30.23 
 
 		 361 aa  129  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  29.72 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.17 
 
 		 384 aa  125  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  30.81 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  29.94 
 
 		 378 aa  122  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  27.81 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  26.32 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.19 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  25.22 
 
 		 362 aa  92.8  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  27.43 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  23.78 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  25 
 
 		 358 aa  86.7  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.36 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03481  recombination protein F  25.23 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  24.02 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  24.02 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  24.02 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  24.02 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.84 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  24.02 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  24.02 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  25.85 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  24.02 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  24.02 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  23.96 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  24.02 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  25.83 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  23.87 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.92 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  24.02 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  25.57 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  25.57 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  24.55 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  25 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  25.07 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  25.57 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.1 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.1 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  23.06 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  24.52 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  25.16 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  25.5 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.92 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  25.87 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.46 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0003  RecF recombinational DNA repair ATPase  23.6 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.16 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1434  recombinational DNA repair ATPase  24.77 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  23.55 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  24.34 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  23.12 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.91 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  22.78 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  25.3 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  23.82 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.08 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000176519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.3 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  24.85 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  25.15 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.31 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  23.82 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  24.63 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>