299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0004 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 372 aa  768    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  47.43 
 
 		 369 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  44.29 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  44.17 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  44.17 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  44.94 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  40.69 
 
 		 375 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  39.89 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  42.51 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  41.51 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  40.4 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  40.4 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  40.11 
 
 		 375 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  40.11 
 
 		 375 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  40.11 
 
 		 375 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  40.11 
 
 		 375 aa  262  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  40.11 
 
 		 375 aa  262  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  40.11 
 
 		 375 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  39.54 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  40.86 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  38.4 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  36.56 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  40.59 
 
 		 374 aa  252  7e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  36.93 
 
 		 372 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.13 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  39.14 
 
 		 371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  38.17 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  38.17 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.66 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.17 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.8 
 
 		 376 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  36.83 
 
 		 374 aa  236  3e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.25 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  33.69 
 
 		 371 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  31.9 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  34.73 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  35.68 
 
 		 370 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.38 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  32.48 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  32.48 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.68 
 
 		 371 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  32.7 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.97 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  37.17 
 
 		 359 aa  205  8e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  32.57 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  33.9 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  34.65 
 
 		 364 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.34 
 
 		 359 aa  202  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  36.49 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  33.16 
 
 		 377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  33.51 
 
 		 376 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  32.95 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.87 
 
 		 369 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  33.87 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  32.08 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  34.9 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  34.9 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.57 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  31.53 
 
 		 364 aa  189  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  30.16 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  30 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  31.02 
 
 		 386 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.82 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  34.86 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  31.3 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  31.37 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  31.74 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  31.37 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  31.37 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  33.53 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  30.83 
 
 		 401 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.29 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  30.83 
 
 		 371 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  34.13 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  32.39 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.6 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  31.07 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  32.22 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  34.65 
 
 		 367 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  31.81 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.94 
 
 		 377 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  32 
 
 		 370 aa  176  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.27 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.97 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  28.36 
 
 		 399 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.78 
 
 		 397 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  27.66 
 
 		 390 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  30.83 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.78 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.03 
 
 		 380 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.19 
 
 		 381 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.43 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.11 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  30.87 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.31 
 
 		 369 aa  169  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  28.65 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.47 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  30.28 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  33.13 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.43 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>