297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0004 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 373 aa  756    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  53.1 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  50.4 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  48.52 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  48.52 
 
 		 375 aa  359  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  48.52 
 
 		 375 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  48.52 
 
 		 375 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  48.52 
 
 		 375 aa  358  6e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  48.52 
 
 		 375 aa  358  6e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  48.52 
 
 		 375 aa  358  6e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  48.52 
 
 		 375 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  48.52 
 
 		 375 aa  358  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  48.25 
 
 		 375 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  48.52 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  48.28 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  46.36 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  48.52 
 
 		 373 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  46.54 
 
 		 370 aa  346  4e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  46.54 
 
 		 370 aa  346  4e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  47.85 
 
 		 374 aa  342  5.999999999999999e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  47.98 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  45.82 
 
 		 359 aa  311  9e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  46.9 
 
 		 366 aa  310  4e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  41.44 
 
 		 371 aa  288  7e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  39.52 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  39.52 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  39.78 
 
 		 375 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.9 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  41.33 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  39.04 
 
 		 371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.7 
 
 		 376 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  36.63 
 
 		 371 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.17 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  39.32 
 
 		 369 aa  233  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  34.18 
 
 		 392 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  38.66 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  34.76 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.76 
 
 		 364 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.1 
 
 		 365 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  38.28 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  36.81 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  37.03 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  30.65 
 
 		 365 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  32.91 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.82 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.69 
 
 		 382 aa  206  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  32.09 
 
 		 364 aa  206  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  32.01 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  36.68 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  36.68 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.15 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  38.07 
 
 		 387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  37.7 
 
 		 377 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  30.67 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.52 
 
 		 363 aa  196  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.99 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  31.91 
 
 		 369 aa  192  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  33.07 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  32.8 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.62 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  32.44 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  31.38 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.26 
 
 		 365 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.91 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.77 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  32.55 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  32.95 
 
 		 365 aa  182  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  31.44 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  31.27 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.49 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  32.1 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  30.11 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  32.7 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.56 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.3 
 
 		 372 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  31.18 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.16 
 
 		 359 aa  176  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.96 
 
 		 420 aa  176  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  34.49 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  34.12 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  33.43 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  31.81 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  34.02 
 
 		 359 aa  170  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.43 
 
 		 363 aa  170  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.3 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  32.46 
 
 		 348 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  31.32 
 
 		 371 aa  169  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.14 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  32.71 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.06 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.94 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  31.5 
 
 		 358 aa  168  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.42 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.61 
 
 		 378 aa  166  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.97 
 
 		 358 aa  166  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  32 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.81 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.61 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  32.6 
 
 		 373 aa  162  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  29.62 
 
 		 377 aa  162  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>