More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0004 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  96.26 
 
 
375 aa  744    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  96.8 
 
 
375 aa  747    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  100 
 
 
375 aa  768    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  96.79 
 
 
375 aa  746    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  96.79 
 
 
375 aa  746    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  97.06 
 
 
375 aa  748    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  96.79 
 
 
375 aa  746    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  97.07 
 
 
375 aa  749    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  97.06 
 
 
375 aa  748    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  95.19 
 
 
373 aa  730    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  97.06 
 
 
375 aa  748    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  67.47 
 
 
374 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  66.03 
 
 
372 aa  524  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  56.64 
 
 
371 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  55.65 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  55.65 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  51.47 
 
 
374 aa  401  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  50.13 
 
 
374 aa  379  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  48.66 
 
 
374 aa  374  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  48.25 
 
 
373 aa  357  9.999999999999999e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  48.1 
 
 
369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  46.47 
 
 
366 aa  328  7e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  48.92 
 
 
359 aa  328  8e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  43.63 
 
 
375 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  45.36 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  42.05 
 
 
361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  42.05 
 
 
361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.55 
 
 
371 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.7 
 
 
360 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  42.23 
 
 
369 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  41.53 
 
 
371 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.89 
 
 
372 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.05 
 
 
376 aa  262  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  38.34 
 
 
364 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  40.8 
 
 
365 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  36.76 
 
 
371 aa  254  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  36.18 
 
 
392 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  34.42 
 
 
365 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  38.48 
 
 
384 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  38.44 
 
 
376 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  33.06 
 
 
365 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.57 
 
 
360 aa  232  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  37.3 
 
 
362 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  37.26 
 
 
386 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  34.96 
 
 
364 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  36.81 
 
 
370 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.42 
 
 
364 aa  222  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  35.99 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  34.53 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  35.63 
 
 
369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  37.57 
 
 
380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  37.57 
 
 
380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  34.31 
 
 
370 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.11 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.98 
 
 
362 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  35.69 
 
 
363 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  30.75 
 
 
402 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  35 
 
 
377 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.29 
 
 
377 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  32.88 
 
 
371 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  30.15 
 
 
401 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.88 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  37.67 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  34.1 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  33.16 
 
 
401 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.39 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.77 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 
370 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  35.83 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.89 
 
 
390 aa  196  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  35.04 
 
 
385 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.16 
 
 
415 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.27 
 
 
359 aa  195  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  35.04 
 
 
365 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  37.13 
 
 
352 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.89 
 
 
374 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  32.01 
 
 
387 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  31.73 
 
 
390 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  32.29 
 
 
371 aa  194  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.89 
 
 
369 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  31.2 
 
 
399 aa  192  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.36 
 
 
378 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.94 
 
 
414 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.77 
 
 
358 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.95 
 
 
365 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.82 
 
 
398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  35.38 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  29.59 
 
 
404 aa  190  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  35.21 
 
 
348 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  29.74 
 
 
390 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  31.52 
 
 
414 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  31.47 
 
 
386 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  31.74 
 
 
377 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  34 
 
 
363 aa  187  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  31.43 
 
 
360 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.97 
 
 
399 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  30.45 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.89 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  30.45 
 
 
380 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  30.45 
 
 
380 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>