297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1991 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  100 
 
 		 366 aa  743    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  69.72 
 
 		 369 aa  523  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  55.8 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  47.44 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  48.79 
 
 		 374 aa  332  5e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  46.72 
 
 		 373 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  46.74 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  46.74 
 
 		 375 aa  329  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  46.47 
 
 		 375 aa  329  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  46.47 
 
 		 375 aa  328  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  46.47 
 
 		 375 aa  328  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  46.47 
 
 		 375 aa  328  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  46.47 
 
 		 375 aa  328  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  46.47 
 
 		 375 aa  328  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  46.47 
 
 		 375 aa  328  8e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  46.47 
 
 		 375 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  47.07 
 
 		 374 aa  323  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  45.53 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  45.38 
 
 		 370 aa  318  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  45.38 
 
 		 370 aa  318  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  45.11 
 
 		 372 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  46.9 
 
 		 373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  42.55 
 
 		 374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  39.39 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  39.39 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  39.57 
 
 		 375 aa  266  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  41.51 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  41.33 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.98 
 
 		 360 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.27 
 
 		 371 aa  256  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  40.91 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  39.94 
 
 		 371 aa  245  9e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  38 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  41.08 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.2 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  39.67 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  34.43 
 
 		 368 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  39.73 
 
 		 384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  37.97 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  34.96 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.07 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  41.5 
 
 		 377 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.07 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  35.79 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  35.65 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  32.57 
 
 		 398 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  38.53 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  37.32 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  35.68 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.05 
 
 		 360 aa  199  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  35.28 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  31.89 
 
 		 392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  31.45 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  39.89 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  39.89 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.02 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.93 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  32.16 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  34.3 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  30.65 
 
 		 365 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  31.02 
 
 		 401 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  34.57 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  32.7 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  33.14 
 
 		 370 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  31.68 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.2 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  30.56 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  31.82 
 
 		 394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  32.35 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.43 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  33.76 
 
 		 385 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.22 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.97 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  32.18 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  30.66 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  28.9 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.62 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  31.74 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.46 
 
 		 369 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  37.04 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  30.63 
 
 		 401 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.96 
 
 		 365 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.64 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  37.04 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  32.01 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  30.86 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.89 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  29.21 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.69 
 
 		 380 aa  173  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  32.75 
 
 		 359 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.32 
 
 		 399 aa  172  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  33.51 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  31.52 
 
 		 371 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  32.57 
 
 		 378 aa  172  9e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  33.24 
 
 		 363 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  30.36 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  30.67 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  31 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0398  recF protein  30.05 
 
 		 364 aa  169  9e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  35.28 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>