279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0042 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 358 aa  696    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  48.6 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  29.72 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.53 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  29 
 
 		 374 aa  182  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  28.77 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  34.12 
 
 		 374 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  31.87 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.68 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  31.88 
 
 		 375 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  30.11 
 
 		 372 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  32.27 
 
 		 375 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  27.67 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  33.06 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  31.69 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.69 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  32.87 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  32.27 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  31.4 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  31.4 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  31.4 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  31.4 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  31.4 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.18 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  31.4 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  31.61 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  33.51 
 
 		 366 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.38 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  32.75 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  29.85 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  28.37 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  30.55 
 
 		 369 aa  169  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.55 
 
 		 364 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.5 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.68 
 
 		 386 aa  165  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  33.33 
 
 		 361 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  33.33 
 
 		 361 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.41 
 
 		 375 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  26.23 
 
 		 392 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  29.76 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  29.76 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.81 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  30.98 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.54 
 
 		 360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0940  DNA replication and repair protein RecF  32.96 
 
 		 355 aa  155  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.94 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.71 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  26.01 
 
 		 371 aa  152  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.57 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  28.17 
 
 		 370 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  23.98 
 
 		 368 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.41 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  28.11 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  27.17 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  27.22 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  30.63 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  27.4 
 
 		 364 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0003  recombination protein F  27.35 
 
 		 360 aa  145  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0188151  hitchhiker  0.0000523089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  27.99 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0003  recombination protein F  27.07 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.316978  hitchhiker  0.00705664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0003  recombination protein F  27.35 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00186248  hitchhiker  0.000000180359 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.79 
 
 		 363 aa  142  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0003  recombination protein F  26.76 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0384357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  30.86 
 
 		 365 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0011  recombination protein F  26.8 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0003  recombination protein F  26.8 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.029356  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  27.35 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.82 
 
 		 372 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  25.9 
 
 		 360 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  25.96 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  25.9 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00005  Recombinational DNA repair ATPase  27.87 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000571812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  25.9 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.31 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  25.9 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  25.41 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  27.78 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  26.9 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0008  recombination protein F  26.24 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0621721  hitchhiker  0.00000000274736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  24.4 
 
 		 398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  23.96 
 
 		 387 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  25.87 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  25.14 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0003  recombination protein F  22.45 
 
 		 367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113705  normal  0.121048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0012  recombination protein F  22.45 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0005  recombination protein F  22.45 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.3 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.27 
 
 		 362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000176519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  28 
 
 		 365 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0003  recombination protein F  22.45 
 
 		 367 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.06 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0003  recombination protein F  23.32 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  23.5 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1434  recombinational DNA repair ATPase  26.57 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  24.02 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  30.74 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0003  recombination protein F  22.74 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.801088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0003  DNA replication and repair protein RecF  23.03 
 
 		 367 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  26.59 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0003  recombination protein F  23.03 
 
 		 369 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>