281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1434 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1434  recombinational DNA repair ATPase  100 
 
 		 395 aa  804    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0043  DNA replication and repair protein RecF  47.24 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  39.11 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  36.91 
 
 		 402 aa  222  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  38.81 
 
 		 371 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  38.31 
 
 		 377 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.24 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  37.43 
 
 		 390 aa  217  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  35.25 
 
 		 401 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.29 
 
 		 380 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.62 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  35.69 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.95 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  33.67 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  34.9 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  34.69 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  35.09 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  34.63 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  35.85 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  33.6 
 
 		 414 aa  199  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.41 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.12 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  35.51 
 
 		 380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  35.51 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  35.51 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  37.06 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.65 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.61 
 
 		 378 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.18 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  33.77 
 
 		 420 aa  193  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.74 
 
 		 401 aa  192  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0234523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  33.92 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  34.9 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  35.2 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.88 
 
 		 399 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  31.49 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  32.14 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  32.14 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  32.14 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  31.85 
 
 		 375 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  31.85 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  31.85 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  31.85 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  31.85 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.89 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  31.85 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  31.55 
 
 		 375 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  34.23 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  34.23 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  32.84 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  32.14 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  31.55 
 
 		 373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.31 
 
 		 485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  32.06 
 
 		 371 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  30.77 
 
 		 369 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  31 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  29.33 
 
 		 364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.61 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  30.9 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  29.91 
 
 		 374 aa  160  5e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  29.73 
 
 		 374 aa  159  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  29.28 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.32 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  30.46 
 
 		 370 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  28.88 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.86 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.96 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.15 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.15 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.12 
 
 		 365 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  34.12 
 
 		 376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.52 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.61 
 
 		 362 aa  146  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  28.83 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0398  recF protein  29.65 
 
 		 364 aa  143  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.74 
 
 		 363 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  31.69 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.34 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  30.84 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  24.41 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  28.99 
 
 		 369 aa  140  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.41 
 
 		 363 aa  139  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  30.75 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  29.48 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  30.97 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.96 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.08 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  28.31 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  30.56 
 
 		 365 aa  136  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  33.73 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  29.97 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  31.87 
 
 		 380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  31.87 
 
 		 380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1620  recombination protein F  31.14 
 
 		 358 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  25.76 
 
 		 369 aa  133  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  29.09 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  29.09 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.47 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  28.05 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  29.28 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>