More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0004 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  100 
 
 
362 aa  720    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  41.37 
 
 
369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.51 
 
 
372 aa  264  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.97 
 
 
360 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  39.88 
 
 
361 aa  245  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  39.88 
 
 
361 aa  245  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.05 
 
 
386 aa  243  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  35.92 
 
 
374 aa  233  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  37.39 
 
 
373 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  37.3 
 
 
375 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  37.3 
 
 
375 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  37.3 
 
 
375 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  37.03 
 
 
375 aa  229  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  37.03 
 
 
375 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  37.03 
 
 
375 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  37.03 
 
 
375 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  37.03 
 
 
375 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  37.03 
 
 
375 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  37.03 
 
 
375 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.66 
 
 
373 aa  227  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  38.98 
 
 
375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.13 
 
 
376 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  34.95 
 
 
374 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  34.6 
 
 
374 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 
371 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  33.6 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  34.05 
 
 
371 aa  212  7e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  34.15 
 
 
369 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.97 
 
 
359 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  38.33 
 
 
364 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  34.23 
 
 
370 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  34.23 
 
 
370 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  36.46 
 
 
374 aa  209  5e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  35.65 
 
 
366 aa  207  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  35.73 
 
 
371 aa  206  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  36.52 
 
 
370 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  36.86 
 
 
359 aa  206  6e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.22 
 
 
382 aa  205  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  32.15 
 
 
365 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  32.88 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.78 
 
 
360 aa  199  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  37.93 
 
 
371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.32 
 
 
364 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.06 
 
 
365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  34.49 
 
 
364 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  33.62 
 
 
370 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.19 
 
 
362 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  34.38 
 
 
373 aa  189  9e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  31.2 
 
 
398 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  34.77 
 
 
359 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.14 
 
 
365 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.91 
 
 
374 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  27.51 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  31.59 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  30.09 
 
 
387 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.04 
 
 
377 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.66 
 
 
363 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  27.86 
 
 
380 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  27.86 
 
 
380 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  27.86 
 
 
380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  32.76 
 
 
359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1549  DNA replication and repair protein RecF  33.78 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.638976  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  28.53 
 
 
369 aa  179  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.94 
 
 
363 aa  179  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  35.16 
 
 
376 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  27.95 
 
 
389 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.84 
 
 
372 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  27.42 
 
 
371 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  27.67 
 
 
386 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  31.9 
 
 
367 aa  176  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.57 
 
 
372 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  33.04 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  32.87 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  29.12 
 
 
392 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.91 
 
 
370 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  35.54 
 
 
390 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.94 
 
 
378 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.3 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.16 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  31.19 
 
 
377 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.73 
 
 
369 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  28.61 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.72 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.35 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  25.32 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.19 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  30.77 
 
 
365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  27.15 
 
 
377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.27 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  35.39 
 
 
380 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  35.39 
 
 
380 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.88 
 
 
399 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  25.68 
 
 
390 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.01 
 
 
379 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  35.5 
 
 
377 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.25 
 
 
401 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0234523  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  26.18 
 
 
377 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  32.78 
 
 
384 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  25.24 
 
 
420 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0940  DNA replication and repair protein RecF  32.19 
 
 
355 aa  159  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>