More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3391 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  100 
 
 		 376 aa  756    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  77.78 
 
 		 371 aa  592  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  67.45 
 
 		 384 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  64.51 
 
 		 390 aa  472  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  67.37 
 
 		 380 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  67.37 
 
 		 380 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  68.53 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  57.1 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  44.93 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  38.98 
 
 		 375 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  38.98 
 
 		 375 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  38.98 
 
 		 375 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  38.71 
 
 		 375 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0394  recombination protein F  47.06 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  38.44 
 
 		 375 aa  275  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  38.17 
 
 		 375 aa  275  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  38.44 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  44.06 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  38.17 
 
 		 373 aa  272  7e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  38.44 
 
 		 375 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  43.77 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.62 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  39.84 
 
 		 374 aa  266  4e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  38.54 
 
 		 374 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  41.08 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  38.03 
 
 		 374 aa  256  5e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  38.71 
 
 		 371 aa  256  7e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  38.27 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1935  recombination protein F  46.84 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  38.07 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  39.08 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  38.07 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  38.34 
 
 		 369 aa  248  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.83 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  35.85 
 
 		 369 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  34.95 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.03 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.64 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  39.83 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  35.47 
 
 		 364 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  32.79 
 
 		 361 aa  229  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  32.79 
 
 		 361 aa  229  9e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  37.4 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22781  recombination protein F  46.22 
 
 		 352 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  36.07 
 
 		 375 aa  225  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  33.96 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.51 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.84 
 
 		 371 aa  222  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.73 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  38.02 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  34.68 
 
 		 398 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  31.99 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17601  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  36.59 
 
 		 325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  35.16 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  34.85 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  35.28 
 
 		 386 aa  206  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17801  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  39.24 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.172283  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.17 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1665  DNA replication and repair protein RecF  37.93 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  34.38 
 
 		 371 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.13 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.83 
 
 		 380 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  35.43 
 
 		 387 aa  195  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  35.88 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.73 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  33.33 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  34.05 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.22 
 
 		 376 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17641  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  38.43 
 
 		 265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.674364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.82 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  34.18 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  37.08 
 
 		 376 aa  190  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  36.34 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.77 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.62 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  33.67 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.58 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.8 
 
 		 382 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  33.7 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  35.22 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  34.33 
 
 		 390 aa  182  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.24 
 
 		 363 aa  182  8.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  33.42 
 
 		 386 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1434  recombinational DNA repair ATPase  34.12 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  32.51 
 
 		 370 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  33.6 
 
 		 389 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  33.95 
 
 		 401 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  35.37 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  32.64 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.06 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  32.64 
 
 		 380 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  32.64 
 
 		 380 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.6 
 
 		 398 aa  176  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1620  recombination protein F  34.96 
 
 		 358 aa  176  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.1 
 
 		 397 aa  175  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  34.37 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  30.91 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>