271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1665 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1665  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 297 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17801  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  92.26 
 
 		 297 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.172283  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17641  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  92.45 
 
 		 265 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.674364  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17601  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  78.45 
 
 		 325 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  47.22 
 
 		 352 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  47.81 
 
 		 348 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  47.81 
 
 		 348 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0394  recombination protein F  42.18 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1935  recombination protein F  45.08 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  36.93 
 
 		 371 aa  203  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22781  recombination protein F  46.53 
 
 		 352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  36.49 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  37.93 
 
 		 376 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  34.12 
 
 		 390 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  33.83 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  33.96 
 
 		 387 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  37.46 
 
 		 377 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  33.98 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  33.98 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.64 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  28.43 
 
 		 371 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  32.41 
 
 		 373 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  32.07 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  32.07 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  32.07 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.21 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  31.72 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  31.72 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  31.72 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  32.96 
 
 		 374 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  29.43 
 
 		 365 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  31.38 
 
 		 375 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  31.38 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  31.38 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  32.48 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  31.03 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  28.04 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  28.04 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.11 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.71 
 
 		 376 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  32.13 
 
 		 375 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  30.07 
 
 		 374 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  29.78 
 
 		 365 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  32.76 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  32.67 
 
 		 369 aa  135  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  27.78 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.32 
 
 		 386 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  29.03 
 
 		 374 aa  128  9.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  30.65 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.74 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.27 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.27 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  31.65 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  29.03 
 
 		 371 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  29.77 
 
 		 364 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  32.56 
 
 		 362 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  27.45 
 
 		 392 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  27.42 
 
 		 378 aa  123  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.4 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.2 
 
 		 364 aa  122  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  28.2 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  23.75 
 
 		 390 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.85 
 
 		 378 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.4 
 
 		 397 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.22 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.64 
 
 		 397 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  29.96 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  27.27 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  26.2 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  30.74 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.01 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  28.27 
 
 		 373 aa  115  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.42 
 
 		 372 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  25.7 
 
 		 390 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.79 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.79 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  28.57 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.48 
 
 		 363 aa  112  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.61 
 
 		 380 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.04 
 
 		 365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  23.95 
 
 		 401 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  27.54 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  25.93 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.18 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  27.72 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  28.51 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  25.88 
 
 		 371 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  24.73 
 
 		 386 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.57 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.47 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  27.78 
 
 		 365 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  23.62 
 
 		 380 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  24 
 
 		 420 aa  109  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  23.62 
 
 		 380 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  23.62 
 
 		 380 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  26.07 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.34 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  27.42 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  28.52 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  29.29 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>