284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0394 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0394  recombination protein F  100 
 
 		 364 aa  707    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1935  recombination protein F  83 
 
 		 353 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  69.41 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22781  recombination protein F  77.19 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  61.99 
 
 		 348 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  62.28 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  45.53 
 
 		 371 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  47.46 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17601  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  42.15 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  43.9 
 
 		 384 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17801  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  42.52 
 
 		 297 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.172283  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  43.67 
 
 		 390 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1665  DNA replication and repair protein RecF  41.84 
 
 		 297 aa  252  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17641  putative DNA repair and genetic recombination protein RecF  44.11 
 
 		 265 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.674364  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  46.37 
 
 		 387 aa  239  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  47.31 
 
 		 377 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  42.47 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  42.47 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  36.24 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  34.5 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  34.5 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  34.5 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  33.8 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  34.21 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  34.21 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  34.21 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  34.11 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  33.92 
 
 		 375 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  33.63 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  33.92 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  33.15 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  35.09 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  32.51 
 
 		 373 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  31.44 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  31.44 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  33.43 
 
 		 374 aa  192  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  34.51 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.88 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.14 
 
 		 360 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.25 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.25 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  35.96 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.91 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.13 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  35.73 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  31.49 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  32.94 
 
 		 375 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  35.81 
 
 		 392 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  33.05 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  33.33 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.62 
 
 		 364 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  31.88 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.27 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  32.97 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  33.33 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  36.42 
 
 		 370 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  33.33 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  33.33 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  34.52 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  32.96 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.09 
 
 		 381 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  32.72 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  31.94 
 
 		 378 aa  169  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  29.5 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.8 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.24 
 
 		 397 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  32.97 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.24 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  32.17 
 
 		 366 aa  166  8e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.01 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.41 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  34.35 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.92 
 
 		 379 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  32.63 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.65 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.09 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.15 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  34.48 
 
 		 371 aa  159  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.02 
 
 		 370 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  33.7 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  32.35 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  35.14 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.29 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  32 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  32.35 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  31.44 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.67 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.79 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.2 
 
 		 399 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  31.36 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  34 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  33.61 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  30.56 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  33.43 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  32.46 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  32.47 
 
 		 377 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  32.6 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.87 
 
 		 415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_002950  PG0398  recF protein  32.05 
 
 		 364 aa  147  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.85 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>