More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0004 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 359 aa  707    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.81 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  35.16 
 
 		 361 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  35.16 
 
 		 361 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  35.71 
 
 		 369 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  38.97 
 
 		 362 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  33.62 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  33.24 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  37.36 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.34 
 
 		 372 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  34.15 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  32.35 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  32.57 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  33.87 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  33.87 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  31.54 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  31.27 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  31.54 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  31.54 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  31.54 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  31.54 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  31.54 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.3 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  31.54 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  31.54 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  36.02 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  31.27 
 
 		 371 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  32.39 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  34.76 
 
 		 359 aa  192  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  33.86 
 
 		 371 aa  192  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  34.29 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  31.28 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.71 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.13 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.05 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.12 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.2 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  32.49 
 
 		 364 aa  179  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.16 
 
 		 373 aa  176  7e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  31.17 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  32.32 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  27.99 
 
 		 370 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  27.78 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  30.46 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.04 
 
 		 360 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  27.88 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  30.37 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  29.49 
 
 		 377 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  25.89 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  31.77 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  30.25 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  28.8 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  30.98 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  29.83 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  25.57 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  26.72 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.65 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.73 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.58 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.36 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.33 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.13 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.19 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  29.02 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  32.09 
 
 		 359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.09 
 
 		 382 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  28.23 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.53 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.48 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  31.17 
 
 		 370 aa  149  6e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.35 
 
 		 363 aa  149  7e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  28.75 
 
 		 366 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.3 
 
 		 372 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  27.93 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  29.1 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  26.27 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  26.93 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  28 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  28.38 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  30.34 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  30.34 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  27.69 
 
 		 414 aa  146  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.03 
 
 		 362 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  27.85 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.58 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0596  DNA replication and repair protein RecF  29.86 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  27.53 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.02 
 
 		 380 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  27.52 
 
 		 359 aa  146  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  29.19 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  27.93 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  27.59 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  26.91 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  26.91 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  31.21 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  29.75 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  26.46 
 
 		 386 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  26.91 
 
 		 380 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  29.46 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  29.59 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>