287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0596 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0596  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 351 aa  719    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.32 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  32.29 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  32.1 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  32.1 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  32.1 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  32.1 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  32.1 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  32.1 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  31.82 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  31.82 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  31.82 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  33.05 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  31.53 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.71 
 
 		 370 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  31.71 
 
 		 374 aa  162  9e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.61 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  32.42 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.97 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  35.16 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  31.27 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.47 
 
 		 386 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.99 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  29.84 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.86 
 
 		 359 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  30.58 
 
 		 366 aa  152  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  32.43 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  34.8 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  31.2 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  30.99 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.24 
 
 		 371 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.23 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  28.34 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  28.34 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.18 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.62 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  32.85 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  32.76 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.35 
 
 		 372 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.23 
 
 		 363 aa  146  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.45 
 
 		 361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.45 
 
 		 361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  30.41 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  29.1 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  30.73 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  29.91 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  29.17 
 
 		 359 aa  143  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  31.3 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  31.51 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  27.99 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.25 
 
 		 358 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  29.23 
 
 		 378 aa  139  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.35 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0398  recF protein  30.7 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  31.95 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.49 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  29.32 
 
 		 390 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  30.22 
 
 		 364 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.03 
 
 		 362 aa  136  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.22 
 
 		 364 aa  135  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  32.15 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  27.64 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  28.7 
 
 		 359 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.1 
 
 		 420 aa  132  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.22 
 
 		 415 aa  132  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  31.87 
 
 		 380 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  31.87 
 
 		 380 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  29.2 
 
 		 373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  31.7 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.65 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.06 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  31.67 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  29.44 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  27.47 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  32.11 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.28 
 
 		 397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  28.42 
 
 		 414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  33.51 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.89 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0053  DNA replication and repair protein RecF  31.4 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.35 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  28.3 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.82 
 
 		 397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  29.3 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  30.19 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  29.89 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  29.43 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  26.79 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  31.9 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  29.43 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  29.43 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.83 
 
 		 377 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.84 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  25.97 
 
 		 367 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  35.13 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  30.77 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  27.65 
 
 		 414 aa  122  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  29.94 
 
 		 386 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  27.45 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  27.15 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>