More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00030 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 414 aa  821    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  50.61 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  50.37 
 
 		 397 aa  352  8e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  47.95 
 
 		 401 aa  347  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  46.28 
 
 		 402 aa  341  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  49.4 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  48.66 
 
 		 381 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  49.76 
 
 		 398 aa  335  7.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  47.66 
 
 		 414 aa  332  7.000000000000001e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  48.61 
 
 		 386 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  48.28 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  48.66 
 
 		 399 aa  327  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  47.33 
 
 		 389 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  49 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  47.67 
 
 		 401 aa  319  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  50.24 
 
 		 391 aa  319  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  48.51 
 
 		 377 aa  318  7.999999999999999e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  48.76 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  47.27 
 
 		 390 aa  315  7e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  45.77 
 
 		 420 aa  315  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0004  DNA replication and repair protein RecF  47.28 
 
 		 401 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0234523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  48.08 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  46.73 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  47.71 
 
 		 380 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  44 
 
 		 415 aa  311  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  48.64 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  47.72 
 
 		 380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  47.72 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  47.72 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  47.24 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  45.32 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  43.61 
 
 		 397 aa  285  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  43 
 
 		 371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0004  DNA replication and repair protein RecF  45.28 
 
 		 485 aa  269  8.999999999999999e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  42.68 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0004  DNA replication and repair protein RecF  48.66 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.22 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1434  recombinational DNA repair ATPase  33.6 
 
 		 395 aa  199  9e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  34.88 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  29.83 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  31.52 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  31.04 
 
 		 375 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  31.04 
 
 		 375 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  31.04 
 
 		 375 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  31.04 
 
 		 375 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  31.12 
 
 		 375 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  31.12 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  30.71 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  30.81 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  30.81 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  30.81 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  29.82 
 
 		 370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  29.82 
 
 		 370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  29.83 
 
 		 374 aa  183  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.22 
 
 		 361 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.22 
 
 		 361 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  30.4 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  30.5 
 
 		 369 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0043  DNA replication and repair protein RecF  27.88 
 
 		 433 aa  180  4.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.16 
 
 		 386 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  29.12 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  29.2 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  31.97 
 
 		 372 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  30 
 
 		 365 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.22 
 
 		 376 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  30.49 
 
 		 374 aa  172  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  36.25 
 
 		 394 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  30.36 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.91 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  31.63 
 
 		 371 aa  170  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.77 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  30.29 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  28.82 
 
 		 364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  31.78 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.05 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  28.57 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  31.62 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  32.2 
 
 		 392 aa  159  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.68 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.65 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  33.25 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  29.64 
 
 		 370 aa  156  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  31.28 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  31.63 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  30.87 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.09 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.16 
 
 		 373 aa  154  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  26.08 
 
 		 362 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  30.39 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.14 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.99 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.3 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.34 
 
 		 370 aa  150  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  29.85 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.81 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  28.93 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.06 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.44 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  32.56 
 
 		 376 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.69 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>