279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1286 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1286  recombination protein F  100 
 
 		 365 aa  749    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  47.92 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  46.13 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  31.89 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  31.83 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  32.4 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.62 
 
 		 384 aa  206  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  31.64 
 
 		 363 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  32.07 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  31.1 
 
 		 391 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  31.83 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  29.49 
 
 		 375 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  30.64 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  31.55 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  29.75 
 
 		 384 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  28.42 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  29.48 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  31.58 
 
 		 357 aa  180  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  30.69 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  30.19 
 
 		 374 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  30.19 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  27.84 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  27.57 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  29.19 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  28.93 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  26.3 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.55 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  26.15 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.84 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  29.6 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  27.25 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  29.57 
 
 		 409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  27.86 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  30.14 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  29.09 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  25.95 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.22 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.22 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.54 
 
 		 385 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  27.12 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  28.16 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  28.73 
 
 		 373 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  28.37 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  25.84 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  26.39 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.46 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  24.38 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.17 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  23.68 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.66 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.79 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  25.79 
 
 		 364 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  25.75 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  25.75 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  25.75 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  26.59 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  25.47 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0003  recombination protein F  23.82 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0661286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  25.47 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  25.47 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.82 
 
 		 386 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  25.47 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  25.47 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.43 
 
 		 372 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  25.75 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.12 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0003  recombination protein F  23.53 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0385213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  25.69 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  23.9 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1225  DNA replication and repair protein RecF  23.23 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.193168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  24.48 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  26 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  26 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0003  recombination protein F  24.48 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0110624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  22.61 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0003  DNA replication and repair protein RecF  23.51 
 
 		 362 aa  92.8  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000176519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.55 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  26.51 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0015  recombination protein F  24.48 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00214178  hitchhiker  0.000779425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  23.86 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0003  recombination protein F  25.55 
 
 		 367 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.801088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  28.53 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  25.34 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  23.99 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  25.47 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  24.63 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0003  recombination protein F  23.94 
 
 		 367 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0005  recombination protein F  23.64 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0003  recombination protein F  24.63 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.029356  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0003  recombination protein F  23.81 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.316978  hitchhiker  0.00705664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0011  recombination protein F  24.63 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0012  recombination protein F  23.44 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  23.43 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0003  recombination protein F  23.44 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113705  normal  0.121048 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  23.82 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4151  recombination protein F  24.12 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000332755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  25.07 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  21.9 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0003  recombination protein F  24.12 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  23.89 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>