More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0015 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 340 aa  682    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  79.94 
 
 		 339 aa  553  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.74 
 
 		 360 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  30.43 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.3 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  29.12 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  28.49 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.01 
 
 		 363 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  28.82 
 
 		 378 aa  136  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.33 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.33 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  27.66 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  31.19 
 
 		 369 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  27.3 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.92 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  28.37 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  26.09 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  28.16 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  28.16 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  28.16 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  28.16 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  31.03 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  28.16 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  28.16 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  28.16 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  28.16 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.8 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  27.32 
 
 		 374 aa  122  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  28.61 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  30 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  28.61 
 
 		 372 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0940  DNA replication and repair protein RecF  30.18 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.65 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  28.91 
 
 		 366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  28.21 
 
 		 369 aa  119  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  27.4 
 
 		 370 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.97 
 
 		 370 aa  118  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  26.92 
 
 		 364 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.57 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.57 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.16 
 
 		 373 aa  118  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  25.85 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  28.77 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  28.16 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  30.77 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.36 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  29.3 
 
 		 368 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  27.99 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.69 
 
 		 369 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  28.9 
 
 		 377 aa  115  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  29.25 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.67 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  26.18 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  28.45 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  27.59 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  25 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.38 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.08 
 
 		 364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  26.03 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  26.38 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  24.85 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0003  recombination protein F  25.66 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0384357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0003  recombination protein F  26.69 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0188151  hitchhiker  0.0000523089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  27.51 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  26.43 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  25.75 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  25 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  27.43 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.35 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0003  recombination protein F  25.88 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  30.58 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  25.29 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4175  recombination protein F  25.88 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0239408  normal  0.0132322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4151  recombination protein F  25.96 
 
 		 361 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000332755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  24.32 
 
 		 414 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  25.41 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  25.57 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  26.51 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.77 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  24.7 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0003  recombination protein F  25.37 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0385213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.17 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.14 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0752559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  25.97 
 
 		 390 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  26.04 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  28.4 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  27.9 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.9 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  25.07 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.01 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0034  recombination protein F  25.88 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000927918  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  26.36 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.56 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  26.42 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0138  recombination protein F  26.18 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0003  recombination protein F  26.88 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.26612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  26.76 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.29 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  23.87 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.53 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>