More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0005 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  91.88 
 
 		 384 aa  660    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  92.41 
 
 		 384 aa  665    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  100 
 
 		 387 aa  776    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  66.23 
 
 		 391 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  58.98 
 
 		 374 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  58.71 
 
 		 374 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  59.25 
 
 		 374 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  56.84 
 
 		 378 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  57.49 
 
 		 409 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  52.69 
 
 		 412 aa  338  8e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  50.81 
 
 		 385 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  51.08 
 
 		 384 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  50.39 
 
 		 385 aa  334  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  50.13 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  50.27 
 
 		 379 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  49.46 
 
 		 378 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  49.73 
 
 		 378 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  50.4 
 
 		 379 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  49.87 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  49.6 
 
 		 378 aa  325  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  51.52 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  48.41 
 
 		 382 aa  318  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  48.21 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  50.41 
 
 		 356 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  48.21 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  50.94 
 
 		 379 aa  308  9e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  48.77 
 
 		 363 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  48.49 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  47.4 
 
 		 363 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  47.86 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.08 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  44.88 
 
 		 357 aa  257  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  42.94 
 
 		 361 aa  256  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  47.83 
 
 		 357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  43.29 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  42.82 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  44.32 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  42.89 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  42.16 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  40.32 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  40.44 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  30.52 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  30.42 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  28.93 
 
 		 365 aa  172  7.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  31.04 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.23 
 
 		 386 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  27.37 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  23.97 
 
 		 362 aa  124  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  27.7 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  26.18 
 
 		 366 aa  122  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.28 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  28.91 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0003  RecF protein  27.56 
 
 		 367 aa  119  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312936  normal  0.12892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0003  recombination protein F  27.85 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0188151  hitchhiker  0.0000523089 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1225  DNA replication and repair protein RecF  31.73 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.193168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.58 
 
 		 377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  27.45 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  25.72 
 
 		 367 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  28.38 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  28.38 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  28.38 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.1 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002007  DNA recombination and repair protein RecF  27.08 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0003677  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  28.38 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  27.68 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.11 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00444  recombination protein F  26.81 
 
 		 357 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0034  recombination protein F  29.6 
 
 		 361 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000927918  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.11 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  27.32 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.56 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  28.64 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  28.17 
 
 		 373 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  26.04 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0003  recombination protein F  28.12 
 
 		 360 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  28.41 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  28.41 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.68 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  28.41 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0003  recombination protein F  27.59 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00186248  hitchhiker  0.000000180359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0003  recombination protein F  27.47 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.029356  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0003  recombination protein F  28.88 
 
 		 361 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  28.61 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  28.61 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  28.61 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0011  recombination protein F  27.47 
 
 		 360 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00668622  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0010  recombination protein F  27.2 
 
 		 360 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  26.95 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.8 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0003  recombination protein F  28.99 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0110624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  28.13 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  25.41 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4151  recombination protein F  29.52 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000332755  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0003  recombination protein F  28.84 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  29.18 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0003  recombination protein F  27.2 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.316978  hitchhiker  0.00705664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.3 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346024  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4175  recombination protein F  29.52 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0239408  normal  0.0132322 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  28.13 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  25.71 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>